Niivue
Niivue是基于Web的可视化工具，用于神经影像学，可以在任何操作系统和任何Web设备（电话，平板电脑，计算机）上运行。该存储库仅包含可以嵌入其他项目的核心Niivue软件包。我们还有其他存储库，这些存储库包裹在Jupyter笔记本，VSCODE和Electron应用程序中。
消息
Niivue iOS应用现在可以在iPhone和iPad上使用。
单击此处查看Niivue Live演示
使Niivue与众不同的是它同时显示所有具有神经影像学流行的数据类型的能力：体素，网格，拖拉机流线，统计图和连接群。基于Voxel的替代网络工具包括AMI，BioImage Suite Web，Brainbrowser，Nifti-Drop，Ohif DiCom查看器，Papaya，VTK.JS和Sledrop。
地方发展
要运行一个热加载开发，每当您将更改保存到任何源文件时都会更新，您可以运行：
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
命令npm run demo将缩小该项目，并在本地托管所有实时演示。开发.md文件为开发人员提供了更多详细信息。
开发人员文档
单击此处获取文档网页
使用niivue的项目和人员
- 功能性神经图像（AFNI）科学和统计计算核心（国立卫生研究院）的分析
- BOOSTLET.JS图像处理插件可与Niivue一起使用。
- Brainchop使用Niivue进行拖放分段，大脑提取和拟释放工具
- brainlife.io将niivue整合到ezbids
- 丹尼尔·海恩（Daniel Haehn）团队的仙人掌正在扩展Niivue绘画和细分功能
- 来自波士顿儿童医院的克里斯研究整合系统（CHRIS）使用Niivue
- 失语症恢复研究中心（C-Star）（南卡罗来纳大学）
- 用于导航MRI数据集的数字脑库
- FMRIB的软件库（FSL）惠康综合神经影像中心（牛津大学）
- 用于计算神经影像学的Freesurfer实验室（马萨诸塞州综合医院）使用Niivue进行FreeBrowse
- openneuro.org使用niivue可视化数据集
- Neurodesk使用niivue进行QSMXT定量敏感映射工具箱
- 神经信息研究与开发小组将Niivue嵌入术中
- 尼勒恩正在扩展ipyniivue
- Niivue-Vscode是用于显示图像的VSCODE扩展
- Quartco在医学成像工作流程中使用Niivue
- FSL临床正在大脑成像报告中使用Niivue
- Brain2Print（来自Niivue团队）使用Niivue显示卷数据和转换的网格
- CT2Print（来自Niivue团队）使用Niivue显示卷和网格数据
- ipyniivue允许在jupyter笔记本中使用niivue
- T2lesion（来自Niivue团队）使用Niivue显示输入数据和分割的病变面具
- Niivue桌面（来自Niivue团队）在交叉Platform电子应用中使用Niivue
- Niivue iOS（来自Niivue团队）在混合Swift + WebView移动应用中使用Niivue
- Niivue忽视使用Niivue可视化空间忽略严重性预测工具中的中风病变数据
- plurimedia在客户工作中使用niivue进行医学图像可视化
资金
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD NOT-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
支持格式
Niivue支持许多流行的大脑成像格式：
- 基于素的格式：NIFTI，NRRD，MRTRIX MIF，AFNI HEAD/BRIK，MGH/MGZ，ITK MHD，ECAT7，DSI-StUDIO SRC。
- 基于网格的格式：Gifti，ASC，BYU/GEO/G，Brainsuite DFS，ICO/Tri，Ply，Brainnet NV，BrainVoyager SRF，Freesurfer，Freesurfer，MZ3，Off，Wavefront OBJ，STL，STL，Legacy VTK，X3D。
- 网状覆盖格式：Gifti，Cifti-2，MZ3，SMP，STC，Freesurfer（curv/annot）
- 拖拉机格式：TCK，TRK，TRX，TSF，TT，VTK，AFNI .niml。
- DICOM：DICOM和DICOM表现
