niivue
Niivueは、あらゆるオペレーティングシステムおよび任意のWebデバイス（電話、タブレット、コンピューター）で実行できるニューロイメージング用のWebベースの視覚化ツールです。このリポジトリには、他のプロジェクトに埋め込むことができるCore Niivueパッケージのみが含まれています。 Jupyterノートブック、VSCode、および電子アプリケーションで使用するためにNiivueをラップする追加のリポジトリがあります。
ニュース
Niivue iOSアプリは、iPhoneとiPadで利用可能になりました。
ここをクリックして、Niivue Live Demosをご覧ください
Niivueをユニークなものにしているのは、ボクセル、メッシュ、トラクトグラフィーの流線、統計マップ、コネクトムなど、ニューロイメージングに人気のあるすべてのデータタイプを同時に表示できることです。代替のボクセルベースのWebツールには、AMI、BioImage Suite Web、Brainbrowser、Nifti-Drop、Ohif DiCom Viewer、Papaya、VTK.JS、Slicedropが含まれます。
ローカル開発
ソースファイルに変更を保存するたびに更新されるホットロード開発を実行するには、実行できます。
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
Command npm run demoプロジェクトを縮小し、すべてのライブデモをローカルでホストします。 develop.mdファイルは、開発者に詳細を提供します。
開発者ドキュメント
Docs Webページについては、ここをクリックしてください
niivueを使用しているプロジェクトと人々
- 機能的な神経イメージ（AFNI）科学的および統計的コンピューティングコア（国立衛生研究所）の分析
- boostlet.js画像処理プラグインはniivueで動作します。
- BrainChopは、ドラッグアンドドロップセグメンテーション、脳の抽出、および区画ツールにNiivueを使用します
- BrainLife.ioは、niivueをezbidsに統合します
- ダニエルヘーンのチームのサボテスは、ニーヴィューの描画とセグメンテーション機能を拡張しています
- ボストン小児病院のChris Research Integration System（CHRIS）
- 失語症研究センター（C-STAR）（サウスカロライナ大学）
- MRIデータセットをナビゲートするためのデジタルブレインバンク
- FMRIBのソフトウェアライブラリ（FSL）統合ニューロイメージングのためのウェルカムセンター（オックスフォード大学）
- FreeSurfer Laboratories for Computational NeuroImaging（マサチューセッツ総合病院）は、NiivueをFreeBrowseに使用します
- openneuro.orgはNiivueを使用してデータセットを視覚化します
- NeurodeskはQSMXTの定量的感受性マッピングツールボックスにniivueを使用します
- Neuroinformatics Research and Development Groupは、トラクトスコープにニービューを埋め込んでいます
- NilearnはiPyniivueを拡張しています
- niivue-vscodeは、画像を表示するためのvscode拡張機能です
- Quantcoは、医療イメージングワークフローでNiivueを使用しています
- FSL Clinicalは、脳イメージングレポートでNiivueを使用しています
- Brain2Print（Niivueチームから）は、Niivueを使用してボリュームデータと変換されたメッシュの両方を表示します
- CT2Print（NIIVUEチームから）は、ボリュームとメッシュのデータを表示するためにNiivueを使用します
- iPyniivueでは、niivueをJupyterノートブックで使用できます
- T2LESION（NIIVUEチームから）がNIIVUEを使用して入力データとセグメント化された病変マスクを表示します
- Niivueデスクトップ（Niivueチームから）は、CrossPlatform ElectronアプリでNiivueを使用します
- niivue iOS（Niivueチームから）は、ハイブリッドSwift + WebViewモバイルアプリでNiivueを使用しています
- Niivue NegrationはNiivueを使用して、空間ネグレクトの重大度予測ツールで脳卒中病変データを視覚化する
- Plurimediaは、医療画像の視覚化のためにクライアント作業でniivueを使用します
資金
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD NOT-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
サポートされている形式
Niivueは多くの人気のある脳イメージング形式をサポートしています：
- Voxelベースの形式：Nifti、Nrrd、MrtrixMif、Afni Head/Brik、MGH/MGZ、ITK MHD、ECAT7、DSI-Studio SRC。
- メッシュベースの形式：Gifti、ASC、BYU/Geo/G、Brainsuite DFS、ICO/TRI、Ply、Brainnet NV、BrainVoyager SRF、FreeSurfer、MZ3、Off、Wavefront OBJ、STL、Legacy VTK、X3d。
- メッシュオーバーレイ形式：Gifti、Cifti-2、MZ3、SMP、STC、FreeSurfer（Curv/Annot）
- トラクトグラフィー形式：TCK、TRK、TRX、TSF、TT、VTK、AFNI .NIML.Tract
- DICOM：DICOMとDICOMマニフェスト
