สิ่งที่มีน้อย
Niivue เป็นเครื่องมือสร้างภาพบนเว็บสำหรับ neuroimaging ที่สามารถทำงานบนระบบปฏิบัติการใด ๆ และอุปกรณ์เว็บใด ๆ (โทรศัพท์แท็บเล็ตคอมพิวเตอร์) ที่เก็บนี้มีเฉพาะ แพ็คเกจหลัก niivue ที่สามารถฝังลงในโครงการอื่น ๆ เรามีที่เก็บเพิ่มเติมที่ห่อ niivue สำหรับใช้ในสมุดบันทึก Jupyter, VSCODE และแอพพลิเคชั่นอิเล็กตรอน
ข่าว
แอพ Niivue iOS มีให้บริการบน iPhone และ iPad แล้ว
คลิกที่นี่เพื่อดูการสาธิต Niivue Live
สิ่งที่ทำให้ Niivue ไม่เหมือนใครคือความสามารถในการแสดงข้อมูลทั้งหมดที่ได้รับความนิยมด้วย neuroimaging: voxels, ตาข่าย, ความคล่องตัวในการเดินเล่น, แผนที่สถิติและการเชื่อมต่อ เครื่องมือบนเว็บทางเลือกที่ใช้ Voxel ได้แก่ AMI, BioImage Suite Web, BrainBrowser, Nifti-Drop, Ohif DICOM Viewer, Papaya, VTK.JS และ Slicedrop
การพัฒนาท้องถิ่น
ในการเรียกใช้การพัฒนาที่โหลดร้อนที่ได้รับการอัปเดตเมื่อใดก็ตามที่คุณบันทึกการเปลี่ยนแปลงไฟล์ต้นฉบับใด ๆ คุณสามารถเรียกใช้:
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
คำสั่ง npm run demo จะลดลงโครงการและเป็นโฮสต์การสาธิตสดทั้งหมด ไฟล์ Develop.md ให้รายละเอียดเพิ่มเติมสำหรับนักพัฒนา
เอกสารนักพัฒนา
คลิกที่นี่สำหรับหน้าเว็บเอกสาร
โครงการและผู้คนที่ใช้ niivue
- การวิเคราะห์การทำงานของ neuroimages (AFNI) แกนการคำนวณทางวิทยาศาสตร์และสถิติ (สถาบันสุขภาพแห่งชาติ)
- ปลั๊กอินการประมวลผลภาพ boostlet.js ทำงานร่วมกับ niivue
- BrainChop ใช้ niivue สำหรับการแบ่งส่วนการลากแล้วปล่อยการสกัดสมองและเครื่องมือ parcellation
- brainlife.io รวม niivue เข้ากับ ezbids
- Cactas จากทีมของ Daniel Haehn กำลังขยายความสามารถในการวาดภาพและการแบ่งส่วน
- Chris Research Integration System (Chris) จากโรงพยาบาลเด็กบอสตันใช้ niivue
- ศูนย์การศึกษาการฟื้นตัวของความพิการทางสมอง (C-STAR) (มหาวิทยาลัยเซาท์แคโรไลนา)
- Digital Brain Bank สำหรับการนำทางชุดข้อมูล MRI
- FMRIB's Software Library (FSL) ศูนย์ Wellcome สำหรับ Neuroimaging เชิงบูรณาการ (University of Oxford)
- FreeSurfer Laboratories สำหรับการคำนวณ neuroimaging (Massachusetts General Hospital) ใช้ niivue สำหรับ freebrowse
- openneuro.org ใช้ niivue เพื่อแสดงชุดข้อมูล
- Neurodesk ใช้ niivue สำหรับกล่องเครื่องมือการแมปความไวต่อปริมาณ QSMXT ของพวกเขา
- กลุ่มวิจัยและพัฒนา Neuroinformatics Embeds Niivue ใน Tractoscope
- Nilearn กำลังขยาย ipyniivue
- Niivue-Vscode เป็นส่วนขยาย vscode สำหรับการแสดงภาพ
- Quantco ใช้ niivue ในเวิร์กโฟลว์การถ่ายภาพทางการแพทย์
- FSL ทางคลินิกกำลังใช้ niivue ในรายงานการถ่ายภาพสมอง
- Brain2print (จากทีม Niivue) ใช้ niivue เพื่อแสดงข้อมูลระดับเสียงและตาข่ายแปลง
- CT2Print (จากทีม Niivue) ใช้ niivue ในการแสดงข้อมูลปริมาณและตาข่าย
- Ipyniivue อนุญาตให้ใช้ niivue ในสมุดบันทึก Jupyter
- T2Lesion (จากทีม Niivue) ใช้ niivue เพื่อแสดงข้อมูลอินพุตและมาสก์แผลที่แบ่งส่วน
- Niivue Desktop (จากทีม Niivue) ใช้ niivue ในแอพอิเล็กตรอน crossplatform
- Niivue iOS (จากทีม Niivue) ใช้ niivue ในแอพมือถือ Hybrid Swift + Webview
- Niivue Presentect ใช้ niivue ในการแสดงข้อมูลรอยโรคหลอดเลือดสมองในเครื่องมือการทำนายความรุนแรงของการละเลยเชิงพื้นที่
- Plurimedia ใช้ niivue ในการทำงานของลูกค้าสำหรับการสร้างภาพข้อมูลทางการแพทย์
เงินทุน
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD NOT-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
รูปแบบที่รองรับ
Niivue สนับสนุนรูปแบบการถ่ายภาพสมองยอดนิยมมากมาย:
- รูปแบบที่ใช้ Voxel: NIFTI, NRRD, MRTRIX MIF, AFNI Head/Brik, MGH/MGZ, ITK MHD, ECAT7, DSI-STUDIO SRC
- รูปแบบที่อิงกับตาข่าย: Gifei, ASC, BYU/GEO/G, Brainsuite DFS, ICO/TRI, PLY, BRINNET NV, BrainVoyager SRF, FreeSurfer, MZ3, Off, Wavefront OBJ, STL, Legacy VTK, X3D
- รูปแบบการซ้อนทับตาข่าย: ของขวัญ, cifti-2, mz3, smp, stc, freesurfer (curv/annot)
- รูปแบบการดำเนินการ: tck, trk, trx, tsf, tt, vtk, afni .niml.tract
- dicom: dicom และ dicom ปรากฏ
