niivue
NIIVUE هي أداة التصور المستندة إلى الويب للتصوير العصبي والتي يمكن أن تعمل على أي نظام تشغيل وأي جهاز ويب (الهاتف ، الكمبيوتر اللوحي ، الكمبيوتر). يحتوي هذا المستودع فقط على حزمة NIIVUE الأساسية التي يمكن تضمينها في مشاريع أخرى. لدينا مستودعات إضافية تلتزم niivue للاستخدام في دفاتر الملاحظات Jupyter و VSCODE وتطبيقات الإلكترون.
أخبار
تطبيق iOS Niivue متوفر الآن على iPhone و iPad.
انقر هنا لمشاهدة العروض التوضيحية الحية niivue
ما يجعل niivue فريدة من نوعها هو قدرتها على عرض جميع أنواع البيانات الشائعة في وقت واحد مع التصوير العصبي: voxels ، الشبكات ، تنسيقات التصوير الفخاري ، الخرائط الإحصائية والاتصالات. تشمل أدوات الويب البديلة المستندة إلى Voxel AMI و BioImage Suite Web و Brainbrowser و NIFT-DROP و OHIF DICOM Viewer و Papaya و VTK.JS و SLICEDROP.
التنمية المحلية
لتشغيل تطوير تحميل ساخن يتم تحديثه كلما قمت بحفظ التغييرات على أي ملفات مصدر ، يمكنك تشغيل:
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
سيقوم Command npm run demo بتوضيح المشروع ويستضيف جميع العروض الحية محليًا. يوفر ملف التطوير. md مزيدًا من التفاصيل للمطورين.
وثائق المطور
انقر هنا للحصول على صفحة ويب المستندات
المشاريع والأشخاص الذين يستخدمون niivue
- تحليل الميزات العصبية الوظيفية (AFNI) جوهر الحوسبة العلمية والإحصائية (المعاهد الوطنية للصحة)
- BOOSTLET.JS معالجة الصور الإضافات مع niivue.
- يستخدم Bruffue niivue لتجزئة السحب والإفلات الخاصة بهم ، واستخراج الدماغ والتشكيل
- Brainlife.io يدمج niivue في ezbids
- تقوم الصبار من فريق دانيال هاين بتمديد قدرات الرسم والتجزئة niivue
- يستخدم نظام تكامل الأبحاث في كريس (كريس) من مستشفى بوسطن للأطفال niivue
- مركز دراسة انتعاش فقدان القدرة على الكلام (C-Star) (جامعة ساوث كارولينا)
- بنك الدماغ الرقمي للتنقل في مجموعات بيانات التصوير بالرنين المغناطيسي
- مكتبة برامج FMRIB (FSL) Wellcome Center للتصوير العصبي التكاملي (جامعة أكسفورد)
- يستخدم مختبرات Freesurfer للتصوير العصبي الحسابي (مستشفى ماساتشوستس العام) niivue for Freebrowse
- يستخدم OpenNeuro.org niivue لتصور مجموعات البيانات
- يستخدم Neurodesk niivue لمربع أدوات التعيين الكمي QSMXT
- مجموعة أبحاث وتنمية المعلوماتية العصبية تتضمن niivue في Tractoscope
- Nilearn يمتد ipyniivue
- niivue-vscode هو امتداد VSCode لعرض الصور
- يستخدم QuantCo niivue في سير عمل التصوير الطبي
- يستخدم FSL Clinical niivue في تقارير تصوير الدماغ
- يستخدم Brain2Print (من فريق Niivue) niivue لإظهار كل من بيانات الحجم والشبكات المحولة
- يستخدم CT2Print (من فريق Niivue) niivue لإظهار البيانات والبيانات الشبكية
- يسمح iPyniivue باستخدام Niivue في دفاتر Jupyter
- يستخدم T2Lesion (من فريق Niivue) niivue لإظهار بيانات الإدخال وأقنعة الآفة المجزأة
- يستخدم سطح المكتب Niivue (من فريق Niivue) niivue في تطبيق الإلكترون المتقاطع
- يستخدم niivue iOS (من فريق Niivue) niivue في تطبيق Mobile Swift Swift + WebView
- يستخدم إهمال niivue niivue لتصور بيانات آفة السكتة الدماغية في أداة التنبؤ بشدة الإهمال المكاني
- تستخدم plurimedia niivue في عمل العميل من أجل تصور الصور الطبية
التمويل
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD NOT-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
التنسيقات المدعومة
يدعم Niivue العديد من تنسيقات تصوير الدماغ الشعبية:
- التنسيقات المستندة إلى Voxel: NIFTI ، NRRD ، MRTRIX MIF ، AFNI HEAD/BRIK ، MGH/MGZ ، ITK MHD ، ECAT7 ، DSI-Studio SRC.
- التنسيقات المستندة إلى الشبكات: Gifti ، ASC ، BYU/GEO/G ، Brainsuite DFS ، ICO/TRI ، ply ، Brainnet NV ، Brainvoyager SRF ، Freesurfer ، MZ3 ، OFF ، واجهة الموجة OBJ ، STL ، Legacy VTK ، X3D.
- تنسيقات تراكب شبكة: Gifti ، Cift-2 ، MZ3 ، SMP ، STC ، Freesurfer (Curv/Enot)
- تنسيقات tractography: TCK ، TRK ، TRX ، TSF ، TT ، VTK ، AFNI .niml.tract
- DICOM: DICOM و DICOM يتجلى
