niivue
Niivue는 모든 운영 체제 및 모든 웹 장치 (전화, 태블릿, 컴퓨터)에서 실행할 수있는 신경 영상을위한 웹 기반 시각화 도구입니다. 이 저장소에는 다른 프로젝트에 포함될 수있는 핵심 Niivue 패키지 만 포함되어 있습니다. Jupyter 노트북, VSCODE 및 전자 응용 분야에서 사용하기 위해 NIIVUE를 감싸는 추가 저장소가 있습니다.
소식
Niivue iOS 앱은 이제 iPhone 및 iPad에서 사용할 수 있습니다.
Niivue 라이브 데모를 보려면 여기를 클릭하십시오
Niivue를 독특하게 만드는 것은 복셀, 메쉬, 트랙토 그래피 간소, 통계지도 및 코네티컷과 같은 신경 영상으로 인기있는 모든 데이터 유형을 동시에 표시하는 능력입니다. 대체 복셀 기반 웹 도구에는 AMI, BioImage Suite Web, Brainbrowser, Nifti-Drop, Ohif Dicom Viewer, Papaya, VTK.JS 및 SlicedRop이 포함됩니다.
지역 개발
모든 소스 파일에 변경 사항을 저장할 때마다 업데이트되는 핫로드 개발을 실행하려면 다음을 실행할 수 있습니다.
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
명령 npm run demo 프로젝트를 미치고 모든 라이브 데모를 로컬로 호스팅합니다. Develop.MD 파일은 개발자에게 자세한 내용을 제공합니다.
개발자 문서
문서 웹 페이지를 보려면 여기를 클릭하십시오
Niivue를 사용하는 프로젝트와 사람들
- 기능적 신경 영상 분석 (AFNI) 과학 및 통계 컴퓨팅 코어 (National Institutes of Health)
- boostlet.js 이미지 처리 플러그인 Niivue와 함께 작동합니다.
- Brainchop은 드래그 앤 드롭 세분화, 뇌 추출 및 파세화 도구에 Niivue를 사용합니다.
- Brainlife.io는 니브 큐를 Ezbids에 통합합니다
- Daniel Haehn 팀의 선인장은 Niivue 드로잉 및 세분화 기능을 확장하고 있습니다.
- Boston Children 's Hospital의 Chris Research Integration System (Chris)
- 실어증 회복 연구 센터 (C-Star) (사우스 캐롤라이나 대학교)
- MRI 데이터 세트 탐색을위한 디지털 뇌 은행
- FMRIB의 소프트웨어 라이브러리 (FSL) Wellcome Center for Integrative Neuroimaging (University of Oxford)
- 계산 신경 영상 (Massachusetts General Hospital)을위한 Freesurfer Laboratories
- OpenNeuro.org는 NIIVUE를 사용하여 데이터 세트를 시각화합니다
- Neurodesk는 QSMXT 정량적 감수성 매핑 도구 상자에 niivue를 사용합니다.
- Neuroinformatics Research and Development Group은 Tractoscope에 Niivue를 포함합니다
- Nilearn은 iPyniivue를 확장하고 있습니다
- niivue-vscode는 이미지를 표시하기위한 vscode 확장자입니다
- Quantco는 의료 이미징 워크 플로에서 Niivue를 사용하고 있습니다
- FSL Clinical은 뇌 영상 보고서에서 Niivue를 사용하고 있습니다
- Brain2Print (Niivue 팀의)는 Niivue를 사용하여 볼륨 데이터와 변환 메시를 모두 보여줍니다
- CT2Print (Niivue 팀의)는 Niivue를 사용하여 볼륨 및 메쉬 데이터를 표시합니다.
- iPyniivue를 사용하면 Niivue가 Jupyter 노트북에서 사용할 수 있습니다
- T2Lesion (Niivue 팀의)은 Niivue를 사용하여 입력 데이터 및 세분화 된 병변 마스크
- Niivue 데스크탑 (Niivue 팀의)
- Niivue iOS (Niivue 팀의) Hybrid Swift + Webview Mobile App에서 Niivue를 사용합니다.
- Niivue Deconlect는 Niivue를 사용하여 공간 방치 심각도 예측 도구에서 뇌졸중 병변 데이터를 시각화합니다.
- Plurimedia는 의료 이미지 시각화를 위해 클라이언트 작업에서 Niivue를 사용합니다.
자금
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD NOD-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
지원되는 형식
Niivue는 많은 인기있는 뇌 영상 형식을 지원합니다.
- 복셀 기반 형식 : NIFTI, NRRD, MRTRIX MIF, AFNI HEAD/BRIK, MGH/MGZ, ITK MHD, ECAT7, DSI-Studio SRC.
- 메시 기반 형식 : Gifti, ASC, Byu/Geo/G, Brainsuite DFS, ICO/Tri, Ply, Brainnet NV, Brainvoyager SRF, Freesurfer, MZ3, Off, Wavefront OBJ, STL, Legacy VTK, X3D.
- 메쉬 오버레이 형식 : Gifti, Cifti-2, MZ3, SMP, STC, Freesurfer (Curv/Annot)
- Tractography 형식 : Tck, Trk, Trx, TSF, TT, VTK, Afni .niml.tract
- Dicom : Dicom과 Dicom이 나타납니다
