Niivue
NIIVUE ist ein webbasiertes Visualisierungstool für Neuroimaging, das auf jedem Betriebssystem und jedem Webgerät (Telefon, Tablet, Computer) ausgeführt wird. Dieses Repository enthält nur das Kern -Niivue -Paket , das in andere Projekte eingebettet werden kann. Wir haben zusätzliche Repositorys, die die Verwendung in Jupyter -Notizbüchern, VSCODE und Elektronenanwendungen einwickeln.
Nachricht
Die Niivue iOS -App ist jetzt auf iPhone und iPad verfügbar.
Klicken Sie hier, um Niivue Live Demos zu sehen
Was Niivue einzigartig macht, ist seine Fähigkeit, alle bei Neuroimaging beliebten Datenatypen gleichzeitig anzuzeigen: Voxel, Maschen, Traktographie -Stromlinien, statistische Karten und Konnektome. Zu den alternativen voxelbasierten Web-Tools gehören AMI, Bioimage Suite Web, Brainbrowser, Nifti-Drop, Ohif Dicom Viewer, Papaya, Vtk.js und Slicedrop.
Lokale Entwicklung
Um eine Hot-Loading-Entwicklung auszuführen, die aktualisiert wird, wenn Sie Änderungen an Quelldateien speichern, können Sie ausführen:
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
Der Befehl npm run demo minimiert das Projekt und veranstaltet lokal alle Live -Demos. Die Develop.MD -Datei enthält mehr Details für Entwickler.
Entwicklerdokumentation
Klicken Sie hier, um die DOCS -Webseite zu erhalten
Projekte und Personen, die Niivue verwenden
- Analyse von funktionellen Neuroimages (AFNI) wissenschaftlichen und statistischen Computerkern (National Institutes of Health)
- Boostlet.js Bildverarbeitungs -Plugins funktionieren mit Niivue.
- Brainchop verwendet Niivue für ihre Drag & Drop
- Brainlife.io integriert Niivue in Ezbids
- Cactas aus Daniel HaehNs Team erweitert die Niivue -Zeichnungs- und Segmentierungsfunktionen
- Chris Research Integration System (CHRIS) vom Boston Children's Hospital verwendet Niivue
- Zentrum für das Studium der Aphasie-Erholung (C-STAR) (Universität von South Carolina)
- Digitale Gehirnbank zum Navigieren von MRT -Datensätzen
- FMRIB -Softwarebibliothek (FSL) Wellcome Center für integrative Neuroimaging (Universität Oxford)
- Freesurfer Laboratories für Computer -Neuroimaging (Massachusetts General Hospital) verwendet Niivue für FreeBrowse
- Openeuro.org verwendet Niivue, um Datensätze zu visualisieren
- Neurodesk verwendet Niivue für ihre QSMXT Quantitative Suszeptibilitätszuordnungswerkzeugkiste
- Forschungs- und Entwicklungsgruppe für Neuroinformatik einbettet Niivue in Traktoskope
- Nilearn erweitert Ipyniivue
- Niivue-VSCODE ist eine VSCODE-Erweiterung zum Anzeigen von Bildern
- Quantco verwendet Niivue in medizinischen Bildgebungsworkflows
- FSL Clinical verwendet Niivue in Hirnbildgebungsberichten
- Brain2Print (vom NIIVUE -Team) verwendet NIIVUE, um sowohl Volumendaten als auch konvertierte Maschen anzuzeigen
- CT2Print (vom Niivue -Team) verwendet Niivue, um Volumen- und Netzdaten anzuzeigen
- Ipyniivue ermöglicht es Niivue, in Jupyter -Notizbüchern verwendet zu werden
- T2LEIsion (vom Niivue -Team) verwendet Niivue, um Eingabedaten und segmentierte Läsionsmasken anzuzeigen
- Niivue -Desktop (vom Niivue -Team) verwendet Niivue in einer Cross -Plattform -Elektronen -App
- Niivue iOS (aus dem Niivue -Team) verwendet Niivue in einer mobilen Hybrid Swift + WebView -App
- NIIVUE VENDAGECT verwendet Niivue, um Schlaganfallläsionsdaten im Tool zur Vorhersage des räumlichen Vernachlässigung der Schwere zu visualisieren
- Plurimedia verwendet Niivue in der Kundenarbeit zur medizinischen Bildvisualisierung
Finanzierung
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD Not-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
Unterstützte Formate
Niivue unterstützt viele beliebte Gehirnbildungsformate:
- Voxelbasierte Formate: Nifti, NRRD, MRTRIX MIF, AFNI-Kopf/BRIK, MGH/MGZ, ITK MHD, ECAT7, DSI-STUDIO SRC.
- Mesh-basierte Formate: Gifti, ASC, BYU/GEO/G, BRAINSUITE DFS, ICO/TRI, PLY, BREINNET NV, BRAINVOYAGER SRF, Freesurfer, MZ3, Off, Wavefront OBJ, STL, Legacy Vtk, X3d.
- Mesh Overlay Formate: Gifti, Cifti-2, MZ3, SMP, STC, Freesurfer (Curv/Annot)
- Traktographieformate: TCK, TRK, TRX, TSF, TT, VTK, AFNI .NIML.
- Dicom: Dicom und Dicom manifestieren sich
