Niivue
Niivue是基於Web的可視化工具，用於神經影像學，可以在任何操作系統和任何Web設備（電話，平板電腦，計算機）上運行。該存儲庫僅包含可以嵌入其他項目的核心Niivue軟件包。我們還有其他存儲庫，這些存儲庫包裹在Jupyter筆記本，VSCODE和Electron應用程序中。
消息
Niivue iOS應用現在可以在iPhone和iPad上使用。
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使Niivue與眾不同的是它同時顯示所有具有神經影像學流行的數據類型的能力：體素，網格，拖拉機流線，統計圖和連接群。基於Voxel的替代網絡工具包括AMI，BioImage Suite Web，Brainbrowser，Nifti-Drop，Ohif DiCom查看器，Papaya，VTK.JS和Sledrop。
地方發展
要運行一個熱加載開發，每當您將更改保存到任何源文件時都會更新，您可以運行：
git clone [email protected]:niivue/niivue.git
cd niivue
npm install
npm run dev
命令npm run demo將縮小該項目，並在本地託管所有實時演示。開發.md文件為開發人員提供了更多詳細信息。
開發人員文檔
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使用niivue的項目和人員
- 功能性神經圖像（AFNI）科學和統計計算核心（國立衛生研究院）的分析
- BOOSTLET.JS圖像處理插件可與Niivue一起使用。
- Brainchop使用Niivue進行拖放分段，大腦提取和擬釋放工具
- brainlife.io將niivue整合到ezbids
- 丹尼爾·海恩（Daniel Haehn）團隊的仙人掌正在擴展Niivue繪畫和細分功能
- 來自波士頓兒童醫院的克里斯研究整合系統（CHRIS）使用Niivue
- 失語症恢復研究中心（C-Star）（南卡羅來納大學）
- 用於導航MRI數據集的數字腦庫
- FMRIB的軟件庫（FSL）惠康綜合神經影像中心（牛津大學）
- 用於計算神經影像學的Freesurfer實驗室（馬薩諸塞州綜合醫院）使用Niivue進行FreeBrowse
- openneuro.org使用niivue可視化數據集
- Neurodesk使用niivue進行QSMXT定量敏感映射工具箱
- 神經信息研究與開發小組將Niivue嵌入術中
- 尼勒恩正在擴展ipyniivue
- Niivue-Vscode是用於顯示圖像的VSCODE擴展
- Quartco在醫學成像工作流程中使用Niivue
- FSL臨床正在大腦成像報告中使用Niivue
- Brain2Print（來自Niivue團隊）使用Niivue顯示卷數據和轉換的網格
- CT2Print（來自Niivue團隊）使用Niivue顯示捲和網格數據
- ipyniivue允許在jupyter筆記本中使用niivue
- T2lesion（來自Niivue團隊）使用Niivue顯示輸入數據和分割的病變面具
- Niivue桌面（來自Niivue團隊）在交叉Platform電子應用中使用Niivue
- Niivue iOS（來自Niivue團隊）在混合Swift + WebView移動應用中使用Niivue
- Niivue忽視使用Niivue可視化空間忽略嚴重性預測工具中的中風病變數據
- plurimedia在客戶工作中使用niivue進行醫學圖像可視化
資金
- 2021-2022 P50 DC014664 NIH NIDCD NOT-OD-21-091
- 2023-2026 RF1 MH133701 NIH NIMH
支持格式
Niivue支持許多流行的大腦成像格式：
- 基於素的格式：NIFTI，NRRD，MRTRIX MIF，AFNI HEAD/BRIK，MGH/MGZ，ITK MHD，ECAT7，DSI-StUDIO SRC。
- 基於網格的格式：Gifti，ASC，BYU/GEO/G，Brainsuite DFS，ICO/Tri，Ply，Brainnet NV，BrainVoyager SRF，Freesurfer，Freesurfer，MZ3，Off，Wavefront OBJ，STL，STL，Legacy VTK，X3D。
- 網狀覆蓋格式：Gifti，Cifti-2，MZ3，SMP，STC，Freesurfer（curv/annot）
- 拖拉機格式：TCK，TRK，TRX，TSF，TT，VTK，AFNI .niml。
- DICOM：DICOM和DICOM表現
