หน้าแรก>แหล่งข้อมูลการสร้างเว็บไซต์>ทรัพยากรอื่นๆ
ดาวน์โหลด

Newt: แอปพลิเคชันตัวอย่างสำหรับ Chise

Newt เป็นแอปพลิเคชั่นตัวอย่างสำหรับไลบรารีบนเว็บที่มีชื่อว่า Chise พัฒนาขึ้นเพื่อให้เห็นภาพและแก้ไขโมเดลเส้นทางที่แสดงโดย Process Description (PD) และภาษากิจกรรม Flow (AF) ของ SBGN, SBML หรือรูปแบบการโต้ตอบอย่างง่าย (SIF)

Chise และแอปพลิเคชันตัวอย่างนี้มีการแจกจ่ายภายใต้ใบอนุญาตสาธารณะ GNU Lesser ทั่วไป

วิธีการอ้างอิงการใช้งาน

โปรดอ้างอิงสิ่งต่อไปนี้เมื่อคุณใช้ Newt:

H. Balci, MC Siper, N. Saleh, I. Safarli, L. Roy, M. Kilicarslan, R. Ozaydin, A. Mazein, C. Auffray, O. Babur, E. Demir และ U. Dogrusoz , Newt: เครื่องมือบนเว็บที่ครอบคลุม 2021.

ซอฟต์แวร์

การปรับใช้แอปพลิเคชันตัวอย่างนี้พร้อมกับเอกสารรายละเอียดเกี่ยวกับการใช้งาน สามารถดูได้ที่นี่ Chise และ Newt ทำงานในทุกแพลตฟอร์มที่มีการสนับสนุน JavaScript รวมถึงอุปกรณ์มือถือ

การรันอินสแตนซ์ท้องถิ่น

ในการปรับใช้และเรียกใช้อินสแตนซ์ท้องถิ่นของเครื่องมือโปรดทำตามขั้นตอนด้านล่าง (เราขอแนะนำให้ใช้เวอร์ชัน 14.19.3 ของ node.js):

  • การติดตั้ง 
 git clone https://github.com/iVis-at-Bilkent/newt.git
cd newt
npm install
  • การรันเครื่องมือ (Windows) 
 npm run debug-build
  • การรันเครื่องมือ (macOS/linux) 
 sudo npm run debug-build

จากนั้นเปิดเว็บเบราว์เซอร์และนำทางไปยัง LocalHost โปรดทราบว่าพอร์ตเริ่มต้นคือ 80 แต่คุณอาจต้องเรียกใช้แอปพลิเคชันนี้ในพอร์ตอื่นเช่น 8080 ในบางแพลตฟอร์มโดยการตั้งค่าตัวแปรสภาพแวดล้อม 'พอร์ต'

การให้เครดิต

ไอคอนที่ผลิตโดย Freepik, Daniel Bruce, Tutsplus, Robin Kylander, Catalin Fertu, Yannick, Icon Works, Flaticon และได้รับใบอนุญาตด้วย Creative Commons โดย 3.0

ห้องสมุดของบุคคลที่สาม: cytoscape.js, A-color-picker, backbone, bootstrap, filesaver.js, jQuery, jQuery-expander, konva, libxmljs, lodemals, browserive MIT; Mousetrap, ขอใบอนุญาตด้วย Apache-2.0, Intro.js ได้รับใบอนุญาตด้วย GNU AGPL และ Chroma-JS ที่ได้รับใบอนุญาตด้วยสิ่งนี้

เราอ้างอิงผู้ใช้ไปยัง Genecards สำหรับคุณสมบัติโดยละเอียดของยีน ในทำนองเดียวกันเราดึงคุณสมบัติของสารเคมีง่าย ๆ จาก Chebi การแปลง Celldesigner ดำเนินการผ่านห้องสมุดนี้และบริการที่เกี่ยวข้อง ในที่สุดการแปลง SBML และ GPML นั้นเกิดจากบริการ Minerva นี้

ทีม

  • Hasan Balci, Selbi Ereshova, Umut Utku Ersahince, Noor Muhammad และ Ugur Dogrusoz จาก I-vis ที่ Bilkent University, Ozgun Babur แห่งมหาวิทยาลัยแมสซาชูเซตส์ที่บอสตัน

ศิษย์เก่า

  • Metin Can Siper, Muhammed Salih Altun, Nasim Saleh, Merve Kilicarslan, Rumeysa Ozaydin, Ilkin Safarli, Ahmet Candiroglu, Kaan Sancak, Ludovic Roy, Leonard Dervishi, Istemi Bahceci
ขยาย
ข้อมูลเพิ่มเติม
แอปที่เกี่ยวข้อง
แนะนำสำหรับคุณ
ข้อมูลที่เกี่ยวข้อง ทั้งหมด