prot2tex protein search

Protex.App

Protex是一種語義搜索工具，使研究人員可以使用自然語言功能描述同時搜索已知和新型蛋白質（例如，“找到可以幫助降解酪氨酸磷酸酶1”的蛋白質）。

由：@rdilip， @alexub，@shawndimantha製造。第二名AI的生成AI黑客馬拉松

它如何工作

演示視頻

OpenAI的剪輯模型用於嵌入蛋白質（從Interpro中刮除）和嵌入式蛋白質序列（使用Meta的ESM嵌入模型獲得）的描述。嵌入在Chromadb中存儲，並執行最近的鄰居矢量搜索以找到用於用戶查詢的最相關的蛋白質。

我們的網站是由React，NextJS，Tailwind CSS和燒瓶建造的。

如何使用

前端可在此鏈接中可用。

為了使後端運行，簡單地：

1. 在protex.py的第13行上提供OpenAi API鍵
2. 運行index.py 。 （可能會提示您安裝一些Python軟件包）
3. 就是這樣！

該網站現在應該完全有效。