prot2tex protein search

Protex.App

O Protex é uma ferramenta de pesquisa semântica que permite que os pesquisadores procurem proteínas conhecidas e novas usando descrição funcional em linguagem natural (por exemplo, "Encontre proteínas que podem ajudar a degradar a tirosina fosfatase 1")

Feito com: @rdilip, @alexub, @ShawnDimantha. 2º lugar em escala A IA generativa de Ai hackathon

Como funciona

Vídeo de demonstração

O modelo de clipe do OpenAI é usado para incorporar ambas as descrições de proteínas (raspadas da Interpro) e a sequência proteica incorporada (obtida usando o modelo de incorporação de ESM da Meta ). As incorporações são armazenadas no Chromadb e uma pesquisa de vetor de vizinho mais próxima é executada para encontrar as proteínas mais relevantes para consultas de usuário.

Nosso site é construído com React, NextJs, Tailwind CSS e Flask .

Como usar

O front -end está disponível neste link.

Para correr o back -end, simplesmente:

1. Forneça sua chave da API OpenAI na linha 13 do protex.py
2. executar index.py . (Você pode ser solicitado a instalar alguns pacotes Python)
3. É isso!

O site agora deve estar totalmente funcional.