prot2tex protein search

Protex.App

Protex-это инструмент для семантического поиска, позволяющий исследователям искать как известных, так и новых белков, используя функциональное описание естественного языка (например, «Найти белки, которые могут помочь разгрозить тирозинфосфатазу 1»)

Сделано с: @rdilip, @alexub, @shawndimantha. 2 -е место в масштабе AI Generative AI Hackathon

Как это работает

Демонстрационное видео

Модель клипа OpenAI используется для встроенного описания белков (соскобаемого из интерпро) и последовательности встроенного белка (полученная с использованием модели встраивания ESM Meta ). Внедрения хранятся в ChromADB , а поиск вектора ближайшего соседа выполняется, чтобы найти наиболее соответствующие белки для пользовательских запросов.

Наш сайт построен с React, NextJS, Tailwind CSS и колбой .

Как использовать

Фронт доступен по этой ссылке.

Чтобы запустить бэкэнд, просто:

1. Предоставьте свой ключ API OpenAI в строке 13 protex.py
2. запустить index.py . (Вам может быть предложено установить несколько пакетов Python)
3. Вот и все!

Сайт теперь должен быть полностью функциональным.