prot2tex protein search

protex.app

Protex adalah alat pencarian semantik yang memungkinkan para peneliti untuk mencari protein yang dikenal & baru menggunakan deskripsi fungsional bahasa alami (misalnya "menemukan protein yang dapat membantu menurunkan tirosin fosfatase 1")

Dibuat dengan: @rdilip, @alexub, @shawndimantha. Tempat ke -2 di skala AI AI Hackathon AI

Cara kerjanya

Video demonstrasi

Model klip Openai digunakan untuk menyematkan kedua deskripsi protein (dikikis dari interpro) dan urutan protein tertanam (diperoleh menggunakan model embedding ESM meta ). Embeddings disimpan dalam ChromadB dan pencarian vektor tetangga terdekat dilakukan untuk menemukan protein yang paling relevan untuk kueri pengguna.

Situs kami dibangun dengan React, NextJS, Tailwind CSS, dan Flask .

Cara menggunakan

Frontend tersedia di tautan ini.

Untuk menjalankan backend, cukup:

1. Berikan kunci API OpenAI Anda di baris 13 dari protex.py
2. Jalankan index.py . (Anda mungkin diminta untuk menginstal beberapa paket Python)
3. Itu saja!

Situs web sekarang harus berfungsi penuh.