prot2tex protein search

Protex.App

Protex是一种语义搜索工具，使研究人员可以使用自然语言功能描述同时搜索已知和新型蛋白质（例如，“找到可以帮助降解酪氨酸磷酸酶1”的蛋白质）。

由：@rdilip， @alexub，@shawndimantha制造。第二名AI的生成AI黑客马拉松

它如何工作

演示视频

OpenAI的剪辑模型用于嵌入蛋白质（从Interpro中刮除）和嵌入式蛋白质序列（使用Meta的ESM嵌入模型获得）的描述。嵌入在Chromadb中存储，并执行最近的邻居矢量搜索以找到用于用户查询的最相关的蛋白质。

我们的网站是由React，NextJS，Tailwind CSS和烧瓶建造的。

如何使用

前端可在此链接中可用。

为了使后端运行，简单地：

1. 在protex.py的第13行上提供OpenAi API键
2. 运行index.py 。 （可能会提示您安装一些Python软件包）
3. 就是这样！

该网站现在应该完全有效。