biodiff

биорад

Сравните двоичные файлы, используя алгоритмы выравнивания.

Что это

Это инструмент для бинарных различий.

Инструмент способен отображать два двоичных файла рядом, так что аналогичные места будут в одном и том же положении с обеих сторон, и байты, отсутствующие с одной стороны, проладились. Он использует алгоритмы биоинформатики из библиотеки «WFA2» или rust-bio (обычно используемой для выравнивания последовательности ДНК) для этого. Диалоговые окна для конфигурации выполняются с использованием cursive .

Функции

• Неоплачиваемый взгляд на перемещение обеих сторон независимо как смежные сегменты байтов
• Выровненное представление для сравнения соответствующих байтов обоих файлов
• Многие конфигурируемые представления байтов (базы 2, 8, 10, 16; смешанные ASCII/HEX, Брайль, римские цифры)
• Режим правого на лето, горизонтальный и вертикальный раздел, ASCII и столб
• Настраиваемые байты на строку, настраиваемые, нажимая [ , ] , 0
• Автоматическое определение ширины путем поиска повторений в видимых/выбранных байтах путем нажатия '='
• Поиск с использованием текста, режима и hexagex

Использование

Выполните biodiff file_a file_b в терминале, и вас следует отбрасывать в шестнадцатеричный вид, показывающий два файла рядом. Первоначально файлы не будут выровнены и отображаются без пробелов с каждой стороны. Перемещая курсор и виды в место, где левая и правая сторона похожа и нажимает F3 (или 3 ), они могут быть выровнены. Это сделано блоком по блоку в стандартной конфигурации, что означает, что байты вблизи курсора выровнены первыми и дальнейшими выровненными блоками, отображаются позже с обеих сторон.

Также возможно выполнить глобальное выравнивание (из всего файлов одновременно), изменив настройки с использованием F4 (обязательно проконсультируйтесь с помощью параметров). Как правило, поскольку это занимает квадратное время и пространство, глобальное выравнивание не будет хорошо работать для файлов, более 64 КБ. Существует также алгоритм «полосы», который быстрее, но немного менее точный.

Вы также можете выбрать область в одном файле, и, нажав F3, алгоритм выравнивания будет выполнять полуглобальное выравнивание, используя выбранные байты в качестве шаблона, чтобы найти соответствующие байты в другом файле.

Также можно распечатать DIFF непосредственно на терминал, используя biodiff --print file_a file_b . В этом случае (если файлы достаточно малы, чтобы не занять слишком много времени), вы можете добавить флаг -gglobal флаг, чтобы сделать глобальное выравнивание (в отличие от блока, который лучше подходит для интерактивного использования).

Установка

Если вам повезет, в вашем основном менеджере пакетов будет доступен пакет. Должны быть загружаемые двоичные файлы для некоторых средах на странице выпусков. В качестве альтернативы, вы также можете установить это с помощью cargo , cargo install biodiff . Вам понадобится Cmake, установленная для компиляции wfa2 . Обратите внимание, что в случае использования Windows вам нужно использовать цель x86_64-unknown-linux-gnu если вы хотите получить поддержку wfa2 .

Вы также можете выполнить непосредственно, используя код из этого репозитория, выполнив cargo run --release -- file_a file_b . Обратите внимание, что файлы конфигурации гарантированно остаются совместимыми между тегами выпусков.

По умолчанию настройки хранятся в каталоге пользователя, специфичной для конкретной платформы. Чтобы использовать пользовательский каталог настроек, установите переменную среды BIODIFF_CONFIG_DIR на желаемый путь каталога перед запуском biodiff . Если каталог не существует, он будет создан автоматически.

Лицензия

Этот проект лицензирован по лицензии MIT.