biodiff

Biodiff

使用對齊算法比較二進製文件。

這是什麼

這是二進制擴散的工具。

該工具能夠並排顯示兩個二進製文件，因此在兩側的相同位置將處於相同的位置，並且一側缺少字節。它使用“ WFA2”或rust-bio庫（通常用於DNA序列比對）的生物信息學算法。用於配置的對話框是使用cursive進行的。

特徵

• 不一對齊的視圖，即以連續字節段獨立移動雙方
• 比較視圖以比較兩個文件的相應字節
• 許多可配置的字節表示（基部2、8、10、16；混合ASCII/六角，盲文，羅馬數字）
• 左右模式，水平和垂直拆分，ASCII和條形柱
• 每行可配置的字節，可通過按[ ， ] ， 0
• 通過按下“ ='”中的“可見/選定”字節中的重複來自動確定寬度
• 使用文字，Regex和Hexagex搜索

用法

在終端中執行biodiff file_a file_b ，您應將您並排顯示兩個文件顯示到十六進制視圖中。最初，文件將不會對齊和顯示，而沒有每一側的空白。通過將光標和視圖移動到左側和右側相似的地方，並按下F3 （或3 ），它們可以對齊。這是按塊在標準配置中按塊完成的，這意味著首先對光標附近的字節對齊，然後在後來兩側顯示進一步的對齊塊。

也可以通過使用F4更改設置（請務必就參數諮詢幫助），對整個文件進行全局對齊。通常，由於需要二次的時間和空間，因此全局對齊對大於64kb的文件無法正常工作。還有一種“帶”的算法，該算法速度更快，但準確率略低。

您還可以在一個文件上選擇一個區域，並按下F3，對齊算法將使用選定的字節作為模式進行半光盤對齊，以在另一個文件上找到相應的字節。

也可以使用biodiff --print file_a file_b直接將差異直接打印到終端。在這種情況下（如果文件足夠小，以至於不需要太長時間），則可以添加-gglobal標誌來執行全局對齊（而不是塊置的標誌，它更適合互動使用）。

安裝

如果幸運的話，您的主要軟件包管理器中將有一個包裹，請參閱“重複”頁面。在版本頁面下的某些環境中應該有可下載的二進製文件。另外，您也可以通過cargo install biodiff來使用cargo進行安裝。您將需要安裝CMAKE，以進行wfa2功能進行編譯。請注意，如果您使用Windows，則需要使用x86_64-unknown-linux-gnu目標，如果您想獲得wfa2支持。

您也可以通過執行cargo run --release -- file_a file_b直接使用此存儲庫中的代碼執行。請注意，僅保證在標記版本之間保持兼容配置文件。

默認情況下，設置存儲在特定於平台的用戶目錄中。要使用自定義設置目錄，請在運行biodiff之前將BIODIFF_CONFIG_DIR環境變量設置為所需的目錄路徑。如果目錄不存在，它將自動創建。

執照

該項目已根據MIT許可獲得許可。