biodiff

Biodiff

使用对齐算法比较二进制文件。

这是什么

这是二进制扩散的工具。

该工具能够并排显示两个二进制文件，因此在两侧的相同位置将处于相同的位置，并且一侧缺少字节。它使用“ WFA2”或rust-bio库（通常用于DNA序列比对）的生物信息学算法。用于配置的对话框是使用cursive进行的。

特征

• 不一对齐的视图，即以连续字节段独立移动双方
• 比较视图以比较两个文件的相应字节
• 许多可配置的字节表示（基部2、8、10、16；混合ASCII/六角，盲文，罗马数字）
• 左右模式，水平和垂直拆分，ASCII和条形柱
• 每行可配置的字节，可通过按[ ， ] ， 0
• 通过按下“ ='”中的“可见/选定”字节中的重复来自动确定宽度
• 使用文字，Regex和Hexagex搜索

用法

在终端中执行biodiff file_a file_b ，您应将您并排显示两个文件显示到十六进制视图中。最初，文件将不会对齐和显示，而没有每一侧的空白。通过将光标和视图移动到左侧和右侧相似的地方，并按下F3 （或3 ），它们可以对齐。这是按块在标准配置中按块完成的，这意味着首先对光标附近的字节对齐，然后在后来两侧显示进一步的对齐块。

也可以通过使用F4更改设置（请务必就参数咨询帮助），对整个文件进行全局对齐。通常，由于需要二次的时间和空间，因此全局对齐对大于64kb的文件无法正常工作。还有一种“带”的算法，该算法速度更快，但准确率略低。

您还可以在一个文件上选择一个区域，并按下F3，对齐算法将使用选定的字节作为模式进行半光盘对齐，以在另一个文件上找到相应的字节。

也可以使用biodiff --print file_a file_b直接将差异直接打印到终端。在这种情况下（如果文件足够小，以至于不需要太长时间），则可以添加-gglobal标志来执行全局对齐（而不是块置的标志，它更适合互动使用）。

安装

如果幸运的话，您的主要软件包管理器中将有一个包裹，请参阅“重复”页面。在版本页面下的某些环境中应该有可下载的二进制文件。另外，您也可以通过cargo install biodiff来使用cargo进行安装。您将需要安装CMAKE，以进行wfa2功能进行编译。请注意，如果您使用Windows，则需要使用x86_64-unknown-linux-gnu目标，如果您想获得wfa2支持。

您也可以通过执行cargo run --release -- file_a file_b直接使用此存储库中的代码执行。请注意，仅保证在标记版本之间保持兼容配置文件。

默认情况下，设置存储在特定于平台的用户目录中。要使用自定义设置目录，请在运行biodiff之前将BIODIFF_CONFIG_DIR环境变量设置为所需的目录路径。如果目录不存在，它将自动创建。

执照

该项目已根据MIT许可获得许可。