NASQAR (recurso de análise de sequência de ácido nucleico):
Uma plataforma baseada na Web para análise e visualização de dados de sequenciamento de alto rendimento
- Pré-impressão: NASQAR: uma plataforma baseada na Web para análise de dados de sequenciamento de alto rendimento e visualização
- Este repo contém o código -fonte da página inicial da Nasqar http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- Abaixo estão os links para os repositórios do GitHub para os aplicativos contidos no NASQAR
- O Dockerfile pode ser usado para construir a última imagem de Nasqar
- A última imagem do Docker para Nasqar está disponível via Dockerhub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
Execute usando o Docker (recomendado):
Verifique se o docker (versão> = 17.03.0-CE) está instalado.
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Isso vai funcionar na porta 80
Para executar em uma porta diferente:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Isso será executado na porta 8083
Aplicativos incluídos no NASQAR
Aplicativos personalizados Nasqar:
- Seuratv3Wizard (scrna)
- SeuratWizard (scrna)
- Deseq2Shiny (RNA a granel)
- GeneCountmerger (pré-processamento)
- Clusterprofshinygsea (enriquecimento)
- Clusterprofshinyora (enriquecimento)
Outros aplicativos de código aberto:
