Nasqar (Ressource für Nukleinsäuresequenzanalyse):
Eine webbasierte Plattform für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenanalyse und Visualisierung
- Vorabdruck: NASQAR: Eine webbasierte Plattform für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenanalyse und Visualisierung
- Dieses Repo enthält den Quellcode für die Nasqar -Homepage http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- Im Folgenden finden Sie Links zu Github -Repos für die in Nasqar enthaltenen Apps
- Die Dockerfile kann verwendet werden, um das neueste Bild von Nasqar zu erstellen
- Das neueste Docker -Bild für Nasqar ist über DockerHub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall verfügbar
Mit Docker ausführen (empfohlen):
Stellen Sie sicher, dass Docker (Version> = 17.03.0-CE) installiert ist.
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Dies wird auf Port 80 ausgeführt
Auf einem anderen Port ausführen:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Dies wird auf Port 8083 ausgeführt
Apps in Nasqar enthalten
Nasqar -benutzerdefinierte Apps:
- Seuratv3Wizard (SCRNA)
- Seuratwizard (SCRNA)
- Deseq2Siny (Bulk -RNA)
- GeneCountmerger (Vorverarbeitung)
- Clusterprofishinygsea (Anreicherung)
- Clusterprofshinyora (Anreicherung)
Andere Open-Source-Apps:
