
NASQAR (مورد تحليل تسلسل الحمض النووي):
منصة قائمة على الويب لتحليل بيانات التسلسل عالي الإنتاجية وتصورها
- ما قبل الطباعة: NASQAR: منصة قائمة على الويب لتحليل بيانات التسلسل عالي الإنتاجية وتصورها
- يحتوي هذا الريبو على الكود المصدري للصفحة الرئيسية لـ Nasqar http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- فيما يلي روابط إلى github repos للتطبيقات الواردة في Nasqar
- يمكن استخدام Dockerfile لبناء أحدث صورة لناسكار
- أحدث صورة Docker لـ Nasqar متوفرة عبر DockerHub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
تشغيل باستخدام Docker (الموصى به):
تأكد من تثبيت Docker (الإصدار> = 17.03.0-CE).
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
سيستمر هذا على المنفذ 80
للركض على منفذ مختلف:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
سيتم تشغيل هذا على المنفذ 8083
التطبيقات المدرجة في Nasqar
تطبيقات NASQAR المخصصة:
- seuratv3wizard (scrna)
- Seuratwizard (Scrna)
- deseq2shiny (الحمض النووي الريبي السائبة)
- GeneCountmerger (المعالجة المسبقة)
- clusterprofshinygsea (الإثراء)
- clusterprofshinyora (الإثراء)
تطبيقات أخرى مفتوحة المصدر: