NASQAR (ресурс анализа последовательности нуклеиновой кислоты):
Веб-платформа для высокопроизводительного анализа и визуализации данных секвенирования
- Предварительный напечаток: NASQAR: веб-платформа для высокопроизводительного анализа данных и визуализации секвенирования
- Этот репо содержит исходный код для домашней страницы NASQAR http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- Ниже приведены ссылки на github Repos для приложений, содержащихся в NASQAR
- DockerFile можно использовать для создания последнего изображения Nasqar
- Последнее изображение Docker для Nasqar доступно через Dockerhub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
Запустите с помощью Docker (рекомендуется):
Убедитесь, что Docker (версия> = 17.03.0-CE) установлен.
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Это будет работать на порту 80
Запустить на другом порту:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Это будет работать на порту 8083
Приложения включены в NASQAR
NASQAR пользовательские приложения:
- Seuratv3wizard (scrna)
- Seuratwizard (scrna)
- deseq2shiny (объемная РНК)
- GeneCountmerger (предварительная обработка)
- ClusterProfshinygsea (обогащение)
- ClusterProfshinyora (обогащение)
Другие приложения с открытым исходным кодом:
