NASQAR (recurso de análisis de secuencia de ácido nucleico):
Una plataforma basada en la web para análisis y visualización de datos de secuenciación de alto rendimiento
- Pre-impresión: NASQAR: una plataforma basada en la web para análisis y visualización de datos de secuenciación de alto rendimiento
- Este repositorio contiene el código fuente para la página de inicio de Nasqar http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- A continuación se presentan enlaces a Repos de GitHub para las aplicaciones contenidas en Nasqar
- El Dockerfile se puede usar para construir la última imagen de Nasqar
- La última imagen de Docker para Nasqar está disponible a través de Dockerhub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
Ejecutar usando Docker (recomendado):
Asegúrese de que Docker (versión> = 17.03.0-CE) esté instalado.
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Esto se ejecutará en el puerto 80
Para ejecutar en un puerto diferente:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Esto se ejecutará en el puerto 8083
Aplicaciones incluidas en Nasqar
Aplicaciones personalizadas de NASQAR:
- SeurATV3Wizard (SCRNA)
- Seuratwizard (SCRNA)
- desq2shiny (ARN a granel)
- Genecountmerger (preprocesamiento)
- ClusterProfshinygsea (enriquecimiento)
- ClusterProfshinyora (enriquecimiento)
Otras aplicaciones de código abierto:
