Nasqar (ทรัพยากรการวิเคราะห์ลำดับกรดนิวคลีอิก):
แพลตฟอร์มบนเว็บสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลการเรียงลำดับสูงและการสร้างภาพข้อมูล
- พิมพ์ล่วงหน้า: NASQAR: แพลตฟอร์มบนเว็บสำหรับการวิเคราะห์และสร้างภาพข้อมูลลำดับสูง
- repo นี้มีซอร์สโค้ดสำหรับหน้าแรกของ Nasqar http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- ด้านล่างนี้คือลิงก์ไปยัง GitHub repos สำหรับแอพที่มีอยู่ใน Nasqar
- DockerFile สามารถใช้ในการสร้างภาพล่าสุดของ Nasqar
- ภาพนักเทียบท่าล่าสุดสำหรับ Nasqar มีให้ผ่าน Dockerhub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
เรียกใช้โดยใช้ Docker (แนะนำ):
ตรวจสอบให้แน่ใจว่ามีการติดตั้ง Docker (เวอร์ชัน> = 17.03.0-CE)
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
สิ่งนี้จะทำงานบนพอร์ต 80
เพื่อทำงานบนพอร์ตอื่น:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
สิ่งนี้จะทำงานบนพอร์ต 8083
แอพที่รวมอยู่ใน Nasqar
แอพที่กำหนดเอง Nasqar:
- Seuratv3Wizard (SCRNA)
- Seuratwizard (SCRNA)
- deseq2shiny (Bulk RNA)
- GenecountMerger (การประมวลผลล่วงหน้า)
- Clusterprofshinygsea (Enrichment)
- Clusterprofshinyora (การตกแต่ง)
แอพโอเพนซอร์ซอื่น ๆ :
