
NASQAR (Sumber Daya Analisis Urutan Asam Nukleat):
Platform berbasis web untuk analisis dan visualisasi data sekuensing throughput tinggi
- Pra-cetak: NASQAR: Platform berbasis web untuk analisis data sekuensing tinggi dan visualisasi
- Repo ini berisi kode sumber untuk beranda Nasqar http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- Di bawah ini adalah tautan ke repo github untuk aplikasi yang terkandung di Nasqar
- Dockerfile dapat digunakan untuk membangun gambar terbaru Nasqar
- Gambar Docker terbaru untuk Nasqar tersedia melalui Dockerhub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
Jalankan menggunakan Docker (disarankan):
Pastikan Docker (Versi> = 17.03.0-CE) diinstal.
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Ini akan berjalan di port 80
Untuk berjalan di port yang berbeda:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Ini akan berjalan di port 8083
Aplikasi Termasuk di Nasqar
Aplikasi Kustom Nasqar:
- Seuratv3Wizard (SCRNA)
- Seuratwizard (SCRNA)
- deseq2shiny (RNA curah)
- Genecountmerger (pra-pemrosesan)
- Clusterprofshinygsea (pengayaan)
- Clusterprofshinyora (pengayaan)
Aplikasi open-source lainnya: