NASQAR

Nasqar（核酸配列分析リソース）：

ハイスループットシーケンスデータ分析と視覚化のためのWebベースのプラットフォーム

• プリプリント：NASQAR：ハイスループットシーケンスデータ分析と視覚化のためのWebベースのプラットフォーム
• このレポは、NASQARホームページhttp://nasqar.abudhabi.nyu.edu/のソースコードが含まれています
• 以下は、Nasqarに含まれるアプリのGitHub Reposへのリンクです
• Dockerfileは、Nasqarの最新画像を構築するために使用できます
• Nasqarの最新のDocker画像は、DockerHub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarallから入手できます。

Dockerを使用して実行する（推奨）：

Docker（バージョン> = 17.03.0-CE）がインストールされていることを確認してください。

 docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar

これはポート80で実行されます

別のポートで実行するには：

 docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar

これはポート8083で実行されます

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Nasqarに含まれるアプリ

Nasqarカスタムアプリ：

• seuratv3wizard（scrna）
• Seuratwizard（Scrna）
• deseq2shiny（バルクRNA）
• GeneCountMerger（前処理）
• clusterProfshinygsea（濃縮）
• clusterprofshinyora（濃縮）

その他のオープンソースアプリ：

• startapp
• deapp
• シャーマン