Nasqar (ressource d'analyse de séquence d'acide nucléique):
Une plate-forme Web pour l'analyse et la visualisation des données de séquençage à haut débit
- Pré-imprimée: NASQAR: une plate-forme Web pour l'analyse et la visualisation des données de séquençage à haut débit
- Ce repos contient le code source de la page d'accueil de Nasqar http://nasqar.abudhabi.nyu.edu/
- Vous trouverez ci-dessous des liens vers des dépôts GitHub pour les applications contenues dans NASQAR
- Le dockerfile peut être utilisé pour construire la dernière image de Nasqar
- La dernière image Docker pour Nasqar est disponible via Dockerhub https://hub.docker.com/r/aymanm/nasqarall
Exécutez à l'aide de Docker (recommandé):
Assurez-vous que Docker (version> = 17.03.0-CE) est installé.
docker run -p 80:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Cela fonctionnera sur le port 80
Pour fonctionner sur un autre port:
docker run -p 8083:80 aymanm/nasqarall:nasqar
Cela fonctionnera sur le port 8083
Applications incluses dans NASQAR
Applications personnalisées Nasqar:
- Seuratv3wizard (SCRNA)
- Seuratwizard (SCRNA)
- Deseq2Shiny (ARN en vrac)
- GeneCountMerger (prétraitement)
- ClusterProfshinygSea (enrichissement)
- ClusterProfshinyora (enrichissement)
Autres applications open source:
