cortix

Cortix

用於網絡動力學建模和HPC模擬的Python庫。

• Jupyter筆記本示例上的Cortix
• 網絡上的文檔

什麼是Cortix？

• Cortix是一個大規模並行的Python庫，用於系統級模塊耦合，執行和分析交換時間相關數據的動態系統模型。
• Cortix作為輸入的計算模塊集合，並為這些模塊耦合到單個模擬提供了一個環境。
• Cortix支持：
  • 模塊解耦
  • 模塊之間的通信
  • 數據可視化
• Cortix在MPI的頂部運行，並在許多核心上進行鱗片。

安裝：從安裝MPI開始

通過PYPI安裝

 pip install --user cortix

如果更新到新版本，則可能需要指定版本

 pip install --user cortix=="<version>"

NB：這不會安裝GraphViz的可執行文件，而只能安裝Python包裝器。自己在系統上安裝GraphViz庫。

通過Conda安裝

在Anaconda環境（MacOS終端Conda或Windows Anaconda Powershell）中：

 pip install cortix
conda install graphviz

如果更新到新版本，則可能需要指定版本

 pip install cortix=="<version>"

從源安裝

1. 克隆此存儲庫來安裝最新版本的Cortix

 git clone https://github.com/dpploy/cortix.git

2. 安裝requirements.txt中列出的所需依賴項.txt

 pip install --user -r cortix/requirements.txt

3. 將cortix的父路徑添加到您的$PYTHONPATH變量

 export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)

注意：您可能需要將此行添加到.bashrc ，以使其持久

通過運行液滴示例來驗證您的Cortix安裝

 mpiexec -n xx examples/run_droplet_swirl.py

其中xx是必須匹配模塊數量加1的MPI過程的數量。如果有10個液滴和1個渦流，請使用 $ xx = 12 $ 。

測試

PYTest促進了測試。測試可以從tests目錄中的本地運行

 cd tests && py.test

使用Cortix

請參考文檔以獲取有關入門的更多信息！

團隊

• Valmor F. de Almeida：[email protected]
• taha M. azzaoui：[email protected]
• Seamus D. Gallagher：seamus_gallagher@s​​​​tudent.uml.edu
• Austin Rotker：[email protected]
• Gilberto E. alas：[email protected]

貢獻

歡迎拉動請求。對於重大更改，請先開設一個問題，以討論您想更改的內容。

請確保及時更新測試。

地點

Cortix組

C/O UMass創新中心

110 Canal St.，三樓

洛厄爾，馬薩諸塞州01852