cortix

Cortix

Perpustakaan Python untuk pemodelan dinamika jaringan dan simulasi HPC.

• CORSI CORTIX ON JUPYTER NOTEBOOK
• Dokumentasi di web

Apa itu Cortix?

• Cortix adalah perpustakaan python paralel yang masif untuk kopling modul tingkat sistem, eksekusi, dan analisis model sistem dinamis yang bertukar data yang bergantung pada waktu.
• Cortix mengambil input kumpulan modul komputasi dan menyediakan lingkungan untuk penggabungan modul -modul ini ke dalam simulasi tunggal.
• Dukungan Cortix:
  • Modul Decoupling
  • Komunikasi antar modul
  • Visualisasi Data
• Cortix berjalan di atas MPI dan timbangan di banyak inti.

Instalasi: Mulailah dengan menginstal MPI

Menginstal melalui PYPI

 pip install --user cortix

Jika memperbarui ke versi baru, Anda mungkin perlu menentukan versi

 pip install --user cortix=="<version>"

NB: Ini tidak akan menginstal GraphViz Executables tetapi hanya pembungkus Python. Instal Perpustakaan GraphViz pada sistem Anda sendiri.

Menginstal melalui conda

Dalam lingkungan Anaconda (terminal macOS conda, atau windows anaconda powershell) lakukan:

 pip install cortix
conda install graphviz

Jika memperbarui ke versi baru, Anda mungkin perlu menentukan versi

 pip install cortix=="<version>"

Menginstal dari sumber

1. Klon Repositori ini untuk menginstal versi terbaru Cortix

 git clone https://github.com/dpploy/cortix.git

2. Instal dependensi yang diperlukan yang tercantum dalam requirements.txt

 pip install --user -r cortix/requirements.txt

3. Tambahkan jalur induk cortix ke variabel $PYTHONPATH Anda

 export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)

Catatan: Anda mungkin ingin menambahkan baris ini ke .bashrc Anda agar gigih

Verifikasi instalasi Cortix Anda dengan menjalankan contoh tetesan

 mpiexec -n xx examples/run_droplet_swirl.py

di mana xx adalah jumlah proses MPI yang harus cocok dengan jumlah modul ditambah 1. Jika ada 10 tetesan dan 1 vortex, gunakan $ xx = 12 $ .

Pengujian

Pengujian difasilitasi oleh Pytest. Tes dapat dijalankan secara lokal dari dalam direktori tests

 cd tests && py.test

Menggunakan Cortix

Silakan merujuk ke dokumentasi untuk lebih lanjut tentang memulai!

Tim

• Valmor F. de Almeida: [email protected]
• Taha M. Azzaoui: [email protected]
• Seamus D. Gallagher: [email protected]
• Austin Rotker: [email protected]
• Gilberto E. Alas: [email protected]

Berkontribusi

Permintaan tarik dipersilakan. Untuk perubahan besar, buka masalah terlebih dahulu untuk membahas apa yang ingin Anda ubah.

Pastikan untuk memperbarui tes yang sesuai.

Lokasi

Grup Cortix

c/o pusat inovasi umass

110 Canal St., lantai 3

Lowell, MA 01852