cortix

Cortix

네트워크 역학 모델링 및 HPC 시뮬레이션을위한 파이썬 라이브러리.

• Jupyter 노트북의 Cortix
• 웹에서 문서

Cortix 란 무엇입니까?

• Cortix는 시간 의존적 데이터를 교환하는 동적 시스템 모델의 시스템 수준 모듈 커플 링, 실행 및 분석을위한 대규모 병렬 파이썬 라이브러리입니다.
• Cortix는 입력으로 계산 모듈 모듈 모듈을 입력하고 이러한 모듈을 단일 시뮬레이션에 연결하기위한 환경을 제공합니다.
• Cortix 지원 :
  • 모듈 디커플링
  • 모듈 간의 통신
  • 데이터 시각화
• Cortix는 MPI 위에서 달리고 많은 코어를 가로 질러 스케일링됩니다.

설치 : MPI를 설치하여 시작하십시오

PYPI를 통해 설치

 pip install --user cortix

새 버전으로 업데이트하는 경우 버전을 지정해야 할 수도 있습니다.

 pip install --user cortix=="<version>"

NB : 이것은 GraphViz 실행 파일이 아니라 파이썬 래퍼 만 설치합니다. 스스로 시스템에 GraphViz 라이브러리를 설치하십시오.

Conda를 통해 설치

Anaconda 환경 (MacOS 터미널 콘다 또는 Windows Anaconda PowerShell)에서 :

 pip install cortix
conda install graphviz

새 버전으로 업데이트하는 경우 버전을 지정해야 할 수도 있습니다.

 pip install cortix=="<version>"

소스에서 설치

1. 이 저장소를 복제하여 최신 버전의 Cortix를 설치하십시오.

 git clone https://github.com/dpploy/cortix.git

2. requirements.txt 에 나열된 필요한 종속성을 설치하십시오 .txt

 pip install --user -r cortix/requirements.txt

3. $PYTHONPATH 변수에 cortix 의 상위 경로를 추가하십시오

 export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)

참고 :이 줄이 .bashrc 에이 줄을 추가하여 영구적으로 추가 할 수 있습니다.

액적 예제를 실행하여 Cortix 설치를 확인하십시오

 mpiexec -n xx examples/run_droplet_swirl.py

여기서 XX는 모듈 수와 1의 수와 일치 해야하는 MPI 프로세스의 수입니다. 10 개의 액 적과 1 개의 소용돌이가있는 경우 사용하십시오. $ xx = 12 $ .

테스트

Pytest에 의해 테스트가 촉진됩니다. tests 디렉토리 내에서 테스트는 로컬로 실행할 수 있습니다.

 cd tests && py.test

Cortix 사용

시작에 대한 자세한 내용은 문서를 참조하십시오!

팀

• Valmor F. de Almeida : [email protected]
• Taha M. Azzaoui : [email protected]
• Seamus D. Gallagher : [email protected]
• Austin Rotker : [email protected]
• Gilberto E. Alas : [email protected]

기여

풀 요청을 환영합니다. 주요 변경 사항을 위해 먼저 문제를 열어 변경하고 싶은 것을 논의하십시오.

테스트를 적절하게 업데이트하십시오.

위치

Cortix 그룹

C/O UMASS 혁신 허브

110 Canal St., 3 층

로웰, MA 01852