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cortix

AI-Quellcode

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Cortix

Eine Python -Bibliothek für Netzwerkdynamikmodellierung und HPC -Simulation.

Cortix on Jupyter Notebook Beispiele
Dokumentation im Web

Was ist Cortix?

Cortix ist eine massiv parallele Python-Bibliothek für die Modulkopplung, Ausführung und Analyse von dynamischen Systemmodellen auf Systemebene, die zeitabhängige Daten austauschen.
Cortix nimmt als Eingabe eine Sammlung von Rechenmodulen ein und bietet eine Umgebung für die Kopplung dieser Module zu einer einzelnen Simulation.
Cortix unterstützt:
- Modulentkopplung
- Kommunikation zwischen Modulen
- Datenvisualisierung
Cortix läuft auf MPI und skaliert über viele Kerne hinweg.

Installation: Beginnen Sie mit der Installation von MPI

Installation über PYPI

 pip install --user cortix

Wenn Sie auf eine neue Version aktualisiert werden, müssen Sie möglicherweise die Version angeben

 pip install --user cortix=="<version>"

NB: Dadurch werden die ausführbaren GraphViz -Ausführungen nicht installiert, sondern nur die Python -Wrapper. Installieren Sie die Graphviz -Bibliothek in Ihrem System selbst.

Installation über Conda

In einer Anaconda -Umgebung (MacOS Terminal Conda oder Windows Anaconda PowerShell):

 pip install cortix
conda install graphviz

Wenn Sie auf eine neue Version aktualisiert werden, müssen Sie möglicherweise die Version angeben

 pip install cortix=="<version>"

Installieren von Quelle

Klonen Sie dieses Repository, um die neueste Version von Cortix zu installieren

 git clone https://github.com/dpploy/cortix.git

Installieren Sie die erforderlichen Abhängigkeiten, die in requirements.txt aufgeführt sind.txt

 pip install --user -r cortix/requirements.txt

Fügen Sie cortix 'S übergeordnete Pfad zu Ihrer $PYTHONPATH -Variablen hinzu

 export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)

Hinweis: Möglicherweise möchten Sie diese Zeile zu Ihrem .bashrc hinzufügen, damit sie persistent ist

Überprüfen Sie Ihre Cortix -Installation, indem Sie das Tropfenbeispiel ausführen

 mpiexec -n xx examples/run_droplet_swirl.py

wobei xx die Anzahl der MPI -Prozesse ist, die mit der Anzahl der Module plus 1 übereinstimmen müssen. Wenn es 10 Tröpfchen und 1 Wirbel gibt, verwenden Sie $ xx = 12 $ .