cortix

Cortix

用于网络动力学建模和HPC模拟的Python库。

• Jupyter笔记本示例上的Cortix
• 网络上的文档

什么是Cortix？

• Cortix是一个大规模并行的Python库，用于系统级模块耦合，执行和分析交换时间相关数据的动态系统模型。
• Cortix作为输入的计算模块集合，并为这些模块耦合到单个模拟提供了一个环境。
• Cortix支持：
  • 模块解耦
  • 模块之间的通信
  • 数据可视化
• Cortix在MPI的顶部运行，并在许多核心上进行鳞片。

安装：从安装MPI开始

通过PYPI安装

 pip install --user cortix

如果更新到新版本，则可能需要指定版本

 pip install --user cortix=="<version>"

NB：这不会安装GraphViz的可执行文件，而只能安装Python包装器。自己在系统上安装GraphViz库。

通过Conda安装

在Anaconda环境（MacOS终端Conda或Windows Anaconda Powershell）中：

 pip install cortix
conda install graphviz

如果更新到新版本，则可能需要指定版本

 pip install cortix=="<version>"

从源安装

1. 克隆此存储库来安装最新版本的Cortix

 git clone https://github.com/dpploy/cortix.git

2. 安装requirements.txt中列出的所需依赖项.txt

 pip install --user -r cortix/requirements.txt

3. 将cortix的父路径添加到您的$PYTHONPATH变量

 export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)

注意：您可能需要将此行添加到.bashrc ，以使其持久

通过运行液滴示例来验证您的Cortix安装

 mpiexec -n xx examples/run_droplet_swirl.py

其中xx是必须匹配模块数量加1的MPI过程的数量。如果有10个液滴和1个涡流，请使用 $ xx = 12 $ 。

测试

PYTest促进了测试。测试可以从tests目录中的本地运行

 cd tests && py.test

使用Cortix

请参考文档以获取有关入门的更多信息！

团队

• Valmor F. de Almeida：[email protected]
• taha M. azzaoui：[email protected]
• Seamus D. Gallagher：seamus_gallagher@s​​tudent.uml.edu
• Austin Rotker：[email protected]
• Gilberto E. alas：[email protected]

贡献

欢迎拉动请求。对于重大更改，请先开设一个问题，以讨论您想更改的内容。

请确保及时更新测试。

地点

Cortix组

C/O UMass创新中心

110 Canal St.，三楼

洛厄尔，马萨诸塞州01852