torchio

代碼教程社區

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原來的	隨機模糊
隨機翻轉	隨機噪聲
隨機仿射轉化	隨機彈性轉化
隨機偏見場偽像	隨機運動偽影
隨機尖峰偽像	隨機的重影工子

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（用於基於補丁的培訓的隊列）

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Torchio是一個Python軟件包，其中包含一組工具，可有效讀取，預處理，樣本，增強和編寫3D醫學圖像，並在Pytorch編寫的深度學習應用程序中，包括強度和空間變換，以增加數據增強和預處理。轉換包括典型的計算機視覺操作，例如隨機仿射變換，以及特定於域的特定擬合操作，例如由於MRI磁場不均勻性或K空間運動偽像的模擬強度偽像的模擬。

該軟件包受到了Niftynet的極大啟發，Niftynet不再積極維護。

學分

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如果您使用此包裝進行研究，請引用我們的論文：

F.Pérez-García，R。 Sparks和S. Ourselin。 TORCHIO：一個用於高效加載，預處理，增強和基於補丁的醫學圖像採樣的Python庫。生物醫學中的計算機方法和程序（2021年6月），第1頁。 106236。 ISSN：0169-2607.DOI：10.1016/j.cmpb.2021.106236。

Bibtex條目：

 @article { perez-garcia_torchio_2021 ,
    title = { {TorchIO}: a {Python} library for efficient loading, preprocessing, augmentation and patch-based sampling of medical images in deep learning } ,
    journal = { Computer Methods and Programs in Biomedicine } ,
    pages = { 106236 } ,
    year = { 2021 } ,
    issn = { 0169-2607 } ,
    doi = { https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2021.106236 } ,
    url = { https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260721003102 } ,
    author = { P{'e}rez-Garc{'i}a, Fernando and Sparks, Rachel and Ourselin, S{'e}bastien } ,
}

該項目得到以下機構的支持：

• 工程與物理科學研究委員會（EPSRC）和英國研究與創新（UKRI）
• EPSRC智能，綜合成像醫療保健（I4Health）（倫敦大學學院）的EPSRC博士培訓中心
• Wellcome / EPSRC介入和外科科學中心（Weiss）（倫敦大學學院）
• 生物醫學工程與成像科學學院（BMEIS）（倫敦國王學院）

入門

請參閱入門以獲取安裝說明和Hello，World！例子。

在教程中可以找到更長的使用示例。

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貢獻者

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