torchio

コードチュートリアルコミュニティ

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オリジナル	ランダムブラー
ランダムフリップ	ランダムノイズ
ランダムアフィン変換	ランダムな弾性変換
ランダムバイアスフィールドアーティファクト	ランダムモーションアーティファクト
ランダムスパイクアーティファクト	ランダムなゴーストアーティファクト

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（パッチベースのトレーニングのためのキュー）

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Torchioは、データの増強と前処理のための強度と空間変換を含む、Pytorchで書かれたディープラーニングアプリケーションで、効率的に読み、プレ前、サンプル、増強、および3D医療画像を効率的に読み、前処理、サンプル、増強、および書き込むツールのセットを含むPythonパッケージです。変換には、ランダムアフィン変換などの典型的なコンピュータービジョン操作や、MRI磁場の不均一性やKスペースモーションアーティファクトによる強度アーティファクトのシミュレーションなどのドメイン固有の変換なども含まれます。

このパッケージは、Niftynetに大きく触発されていますが、これは積極的に維持されていません。

クレジット

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このパッケージを調査に使用する場合は、私たちの論文を引用してください。

F.Pérez-García、R。Sparks、およびS. Ourselin。 Torchio：深い学習における医療画像の効率的な負荷、前処理、増強、パッチベースのサンプリングのためのPythonライブラリ。バイオメディシンのコンピューター方法とプログラム（2021年6月）、p。 106236。ISSN：0169-2607.DOI：10.1016/j.cmpb.2021.106236。

bibtexエントリ：

 @article { perez-garcia_torchio_2021 ,
    title = { {TorchIO}: a {Python} library for efficient loading, preprocessing, augmentation and patch-based sampling of medical images in deep learning } ,
    journal = { Computer Methods and Programs in Biomedicine } ,
    pages = { 106236 } ,
    year = { 2021 } ,
    issn = { 0169-2607 } ,
    doi = { https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2021.106236 } ,
    url = { https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260721003102 } ,
    author = { P{'e}rez-Garc{'i}a, Fernando and Sparks, Rachel and Ourselin, S{'e}bastien } ,
}

このプロジェクトは、次の機関によってサポートされています。

• 工学および物理科学研究評議会（EPSRC）および英国の研究とイノベーション（UKRI）
• Healthcare（I4Health）（University College London）におけるインテリジェント、統合イメージングの博士課程訓練センターEPSRCセンター
• Wellcome / EPSRC介入および外科科学センター（Weiss）（University College London）
• 生物医学工学およびイメージング科学部（BMEIS）（キングスカレッジロンドン）

はじめる

インストールの指示とこんにちは、Worldについては、開始を参照してください！例。

より長い使用例は、チュートリアルに記載されています。

すべてのドキュメントは、ドキュメントの読み取りでホストされています。

何かが欠けていると思われる場合は、新しい問題を開いてください。

貢献者

これらすべての人々に感謝します（絵文字キー）：

フェルナンド・ペレス・ガルシア	Valabregue ？ ？ ？	gfabien ？ ？	G.reguig	ニールズ・シュリンリンク	イブラヒム・ハジック ？	ルベンドー ？
ジュリアン・クルグ ？	DavidVölgyes ？	Jean-Christophe Fillion-Robin	スラジパイ ？	ベンダーウィン ？	Oeslle Lucena ？	Soumick Chatterjee
ニューロンフロー	ヤン・ヴェウキー	デルクムス ？	クリスチャン・ヘルツ ？	Cory Efird ？	Esteban Vaca C. ？	レイファン ？
Akis Linardos ？	ニーナ・モンタナ・ブラウン ？	Fabien-Brulport ？	Malteekj ？	アンドレス・ディアス・ピント ？	サルタック・パティ ？	gabriellakamlish ？
タイラー・スピアーズ ？	ダガット	Xiangyu Zhao ？	Siahuat0727 ？	svdvoort	albans98	マシュー・T・ワルケンティン
Glupol ？	Ramonemiliani93 ？	Justus Schock ？ ？ ？	ステファン・ミロラド・ラドニッチ ？	サジャン・ゴヒル ？	Ikko Ashimine	laynr
Omar U. Espejel ？	ジェームズ・バトラー ？	RES191 ？	Nengwp ？	スーザンベラクラーケ ？	ネペシカ ？	セバスチャン・ペンフエット ？
ビッグシリオン ？	DženanZukić ？	VASL12 ✅？？	フランソワルソー ？	スナヴァルム	ジェイコブラインホールド	HSU ？
snipdome ？	スマリー ？	Guigautier ？	ayedsamy ？	J.ミゲルバルベルデ ？ ？	JoséGuilhermeAlmeida ？	アシム・ウスマン ？
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アーサーマッソン ？	양현식	ニコロシュ ？	アムンドヴェーダル	アラバマガン ？	sbdoherty	Zhack47 ？
ブレイク・デューイ	ドイオン・キム ？	konomaxi ？	ローラン・チャウビン ？	クリスチャンヒンジ ？	Zzz123xyz ？	アミンアラム
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