torchio
v0.20.3
| Asli | Blur acak |
| Flip acak | Kebisingan acak |
| Transformasi afin acak | Transformasi elastis acak |
| Artefak bidang bias acak | Artefak gerak acak |
| Artefak lonjakan acak | Artefak ghosting acak |
(Antrian untuk pelatihan berbasis tambalan)
Torchio adalah paket Python yang berisi serangkaian alat untuk membaca secara efisien, preprocess, sampel, augment, dan menulis gambar medis 3D dalam aplikasi pembelajaran mendalam yang ditulis dalam pytorch, termasuk intensitas dan transformasi spasial untuk augmentasi data dan preprocessing. Transformasi meliputi operasi visi komputer yang khas seperti transformasi afin acak dan juga yang spesifik domain seperti simulasi artefak intensitas akibat inhomogenitas medan magnet MRI atau artefak gerak-space.
Paket ini telah sangat terinspirasi oleh Niftynet, yang tidak dipertahankan secara aktif lagi.
Jika Anda menyukai repositori ini, silakan klik Star!
Jika Anda menggunakan paket ini untuk penelitian Anda, silakan kutip makalah kami:
F. Pérez-García, R. Sparks, dan S. Ourselin. Torchio: Perpustakaan Python untuk pemuatan yang efisien, preprocessing, augmentasi dan pengambilan sampel berbasis tambalan gambar medis dalam pembelajaran mendalam . Metode dan program komputer dalam biomedis (Juni 2021), hal. 106236. ISSN: 0169-2607.doi: 10.1016/j.cmpb.2021.106236.
Entri Bibtex:
@article { perez-garcia_torchio_2021 ,
title = { {TorchIO}: a {Python} library for efficient loading, preprocessing, augmentation and patch-based sampling of medical images in deep learning } ,
journal = { Computer Methods and Programs in Biomedicine } ,
pages = { 106236 } ,
year = { 2021 } ,
issn = { 0169-2607 } ,
doi = { https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2021.106236 } ,
url = { https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260721003102 } ,
author = { P{'e}rez-Garc{'i}a, Fernando and Sparks, Rachel and Ourselin, S{'e}bastien } ,
}Proyek ini didukung oleh lembaga -lembaga berikut:
Lihat Memulai Instruksi Instalasi dan Dunia Hello, World! contoh.
Contoh penggunaan yang lebih lama dapat ditemukan di tutorial.
Semua dokumentasi di -host saat membaca dokumen.
Harap buka masalah baru jika Anda berpikir ada sesuatu yang hilang.
Terima kasih kepada semua orang ini (Kunci Emoji):
Fernando Pérez-García | Valabregue ? ? ? | Gfabien ? ? | G.RegUig | Niels Schurink | Ibrahim Hadzic ? | Reubendo ? |
Julian Klug ? | David Völgyes ? | Jean-Christophe Fillion-Robin | Suraj Pai ? | Ben Darwin ? | Oeslle Lucena ? | Soumick Chatterjee |
Neuronflow | Jan Witowski | Derk Mus ? | Christian Herz ? | Cory Efird ? | Esteban Vaca C. ? | Ray Phan ? |
Akis Linardos ? | Nina Montana-Brown ? | Fabien-Brulport ? | Malteekj ? | Andres Diaz-Pinto ? | Sarthak Pati ? | Gabriellakamlish ? |
Tyler Spears ? | Dagut | Xiangyu Zhao ? | siahuat0727 ? | Svdvoort | Albans98 | Matthew T. Warkentin |
Glupol ? | Ramonemiliani93 ? | Justus Schock ? ? ? | Stefan Milorad Radonjić ? | Sajan Gohil ? | Ikko Ashimine | Laynr |
Omar U. Espejel ? | James Butler ? | res191 ? | nengwp ? | Susanveraclarke ? | Nepersica ? | Sebastian Penhouet ? |
Bigsealion ? | Dženan Zukić ? | Vasl12 ✅? | François Rousseau ? | Snavalm | Jacob Reinhold | Hsu ? |
Snipdome ? | Smally ? | Guigautier ? | Ayedsamy ? | J. Miguel Valverde ? ? | José Guilherme Almeida ? | Asim Usman ? |
CBRI92 ? | Markus J. Ankenbrand ? | Ziv Yaniv | Luca Lumetti | Chagelo ? | Mueller-Franzes ? | Abdelwahab Kawafi ? |
Arthur Masson ? | 양현식 | Nicoloesch ? | Amund Vedal | Alabamagan ? | SBDOHERTY | Zhack47 ? |
Blake Dewey | Doyeon Kim ? | Konomaxi ? | Laurent Chauvin ? | Engsel Kristen ? | ZZZ123XYZ ? | Amin Alam |
Marius-sm ? | haarisr | Chris Winder ? | Ricky Walsh | Keerthi Sravan Ravi ? |
Proyek ini mengikuti spesifikasi semua-kontributor. Kontribusi apa pun yang baik!
