torchio

암호 튜토리얼 지역 사회

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원래의	무작위 흐림
임의의 플립	무작위 노이즈
무작위 아핀 변환	무작위 탄성 변환
무작위 바이어스 필드 아티팩트	임의의 모션 아티팩트
임의의 스파이크 유물	임의의 고스트 유물

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(패치 기반 교육을위한 대기열)

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Torchio는 데이터 확대 및 전처리를위한 강도 및 공간 변환을 포함하여 Pytorch에서 작성된 딥 러닝 애플리케이션에서 효율적으로 읽기, 전제, 샘플, 증강 및 쓰기위한 일련의 도구를 포함하는 파이썬 패키지입니다. 변환에는 무작위 아핀 변환과 같은 전형적인 컴퓨터 비전 작업 및 MRI 자기장 불균일성 또는 K- 공간 모션 아티팩트로 인한 강도 아티팩트 시뮬레이션과 같은 도메인-특이 적 조작이 포함됩니다.

이 패키지는 Niftynet에서 크게 영감을 받았으며 더 이상 적극적으로 유지되지 않습니다.

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이 패키지를 연구에 사용하는 경우, 우리의 논문을 인용하십시오.

F. Pérez-García, R. Sparks 및 S. Ourselin. Torchio : 딥 러닝에서 의료 이미지의 효율적인 하중, 전처리, 증강 및 패치 기반 샘플링을위한 파이썬 라이브러리 . 생체 의학의 컴퓨터 방법 및 프로그램 (2021 년 6 월), p. 106236. ISSN : 0169-2607.DOI : 10.1016/j.cmpb.2021.106236.

Bibtex 항목 :

 @article { perez-garcia_torchio_2021 ,
    title = { {TorchIO}: a {Python} library for efficient loading, preprocessing, augmentation and patch-based sampling of medical images in deep learning } ,
    journal = { Computer Methods and Programs in Biomedicine } ,
    pages = { 106236 } ,
    year = { 2021 } ,
    issn = { 0169-2607 } ,
    doi = { https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2021.106236 } ,
    url = { https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260721003102 } ,
    author = { P{'e}rez-Garc{'i}a, Fernando and Sparks, Rachel and Ourselin, S{'e}bastien } ,
}

이 프로젝트는 다음 기관에서 지원합니다.

• 엔지니어링 및 물리 과학 연구위원회 (EPSRC) 및 영국 연구 및 혁신 (UKRI)
• EPSRC 의료 분야의 지능형 통합 영상 (I4Health) (University College London)에서 박사 과정 교육 센터
• Wellcome / EPSRC 개입 및 외과 과학 센터 (WEISS) (University College London)
• 생의학 공학 및 영상 과학 학교 (BMEIS) (King 's College London)

시작하기

설치 지침과 Hello, World를위한 시작을 참조하십시오! 예.

더 긴 사용 예제는 튜토리얼에서 찾을 수 있습니다.

모든 문서는 Docs Read에서 호스팅됩니다.

뭔가 빠졌다고 생각되면 새로운 문제를여십시오.

기고자

이 모든 사람들에게 감사드립니다 (이모티콘 키) :

Fernando Pérez-García	Valabregue ? ? ?	gfabien ? ?	G.reguig	Niels Schurink	Ibrahim Hadzic ?	루벤도 ?
줄리안 클루그 ?	David Völgyes ?	Jean-Christophe Fillion-Robin	수 라지 파이 ?	벤 다윈 ?	Oeslle Lucena ?	Soumick Chatterjee
뉴런 흐름	Jan Witowski	Derk Mus ?	크리스티안 헤르즈 ?	Cory Efird ?	Esteban Vaca C. ?	레이 판 ?
Akis Linardos ?	니나 몬태나-브라운 ?	Fabien-Brulport ?	Malteekj ?	Andres Diaz-Pinto ?	사스 팍 파티 ?	Gabriellakamlish ?
타일러 스피어 ?	Dagut	Xiangyu Zhao ?	SIAHUAT0727 ?	svdvoort	albans98	Matthew T. Warkentin
글루 폴 ?	Ramonemiliani93 ?	Justus Schock ? ? ?	Stefan Milorad Radonjić ?	Sajan Gohil ?	이코 아시민	평신도
Omar U. Espejel ?	제임스 버틀러 ?	RES191 ?	nengwp ?	Susanveraclarke ?	네페 시카 ?	세바스찬 펜 후우 ?
Bigsealion ?	Dženan Zukić ?	VASL12 ✅?	François Rousseau ?	Snavalm	Jacob Reinhold	HSU ?
snipdome ?	웃으며 ?	기운 타이어 ?	Ayedsamy ?	J. Miguel Valverde ? ?	José Guilherme Almeida ?	Asim Usman ?
CBRI92 ?	Markus J. Ankenbrand ?	Ziv Yaniv	루카 루메티	Chagelo ?	뮬러-프란 즈 ?	압델 와하 가브 카와 피 ?
Arthur Masson ?	양현식	니콜 로스 ?	Amund Vedal	앨라 바마 간 ?	SBDOHERTY	Zhack47 ?
블레이크 듀이	도현 김 ?	Konomaxi ?	Laurent Chauvin ?	기독교 힌지 ?	ZZZ123XYZ ?	아민 알람
마리우스 -SM ?	Haarisr	Chris Winder ?	리키 월시	Keerthi Sravan Ravi ?

이 프로젝트는 All-Contritors 사양을 따릅니다. 모든 종류의 공헌을 환영합니다!