หน้าแรก>การเขียนโปรแกรมที่เกี่ยวข้อง>หลาม
ดาวน์โหลด

รหัส บทเรียน ชุมชน

ต้นฉบับ เบลอแบบสุ่ม
การพลิกแบบสุ่ม เสียงรบกวนแบบสุ่ม
การเปลี่ยนแปลงเลียนแบบแบบสุ่ม การเปลี่ยนแปลงแบบยืดหยุ่นแบบสุ่ม
สิ่งประดิษฐ์ภาคสนามแบบสุ่ม สิ่งประดิษฐ์การเคลื่อนไหวแบบสุ่ม
แบบสุ่มสไปค์สิ่งประดิษฐ์ สิ่งประดิษฐ์ผีแบบสุ่ม

(คิวสำหรับการฝึกอบรมตามแพตช์)

Torchio เป็นแพ็คเกจ Python ที่มีชุดเครื่องมือในการอ่านอย่างมีประสิทธิภาพประมวลผลตัวอย่างการเพิ่มและเขียนภาพการแพทย์ 3 มิติในแอพพลิเคชั่นการเรียนรู้ลึกที่เขียนใน Pytorch รวมถึงความเข้มและการแปลงเชิงพื้นที่สำหรับการเพิ่มข้อมูลและการประมวลผลล่วงหน้า การแปลงรวมถึงการดำเนินการด้วยการมองเห็นคอมพิวเตอร์ทั่วไปเช่นการแปลงแบบสุ่มและการเปลี่ยนแปลงเฉพาะของโดเมนเช่นการจำลองสิ่งประดิษฐ์ความเข้มเนื่องจากสนามแม่เหล็ก MRI มีความไม่แน่นอนหรือ K-space motion สิ่งประดิษฐ์

แพ็คเกจนี้ได้รับแรงบันดาลใจอย่างมากจาก Niftynet ซึ่งไม่ได้รับการดูแลอย่างแข็งขันอีกต่อไป

การให้เครดิต

หากคุณชอบที่เก็บนี้โปรดคลิกที่ Star!

หากคุณใช้แพ็คเกจนี้สำหรับการวิจัยของคุณโปรดอ้างอิงบทความของเรา:

F. Pérez-García, R. Sparks และ S. Ourselin Torchio: ไลบรารี Python สำหรับการโหลดที่มีประสิทธิภาพการประมวลผลล่วงหน้าการเพิ่มและการสุ่มตัวอย่างที่ใช้แพทช์ของภาพทางการแพทย์ในการเรียนรู้อย่างลึกซึ้ง วิธีการคอมพิวเตอร์และโปรแกรมใน biomedicine (มิถุนายน 2021), p. 106236. ISSN: 0169-2607.doi: 10.1016/j.cmpb.2021.106236

รายการ bibtex: 

 @article { perez-garcia_torchio_2021 ,
    title = { {TorchIO}: a {Python} library for efficient loading, preprocessing, augmentation and patch-based sampling of medical images in deep learning } ,
    journal = { Computer Methods and Programs in Biomedicine } ,
    pages = { 106236 } ,
    year = { 2021 } ,
    issn = { 0169-2607 } ,
    doi = { https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2021.106236 } ,
    url = { https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260721003102 } ,
    author = { P{'e}rez-Garc{'i}a, Fernando and Sparks, Rachel and Ourselin, S{'e}bastien } ,
}

โครงการนี้ได้รับการสนับสนุนโดยสถาบันต่อไปนี้:

  • สภาวิจัยวิศวกรรมและวิทยาศาสตร์กายภาพ (EPSRC) และการวิจัยและนวัตกรรมของสหราชอาณาจักร (UKRI)
  • ศูนย์ EPSRC สำหรับการฝึกอบรมระดับปริญญาเอกในการถ่ายภาพอัจฉริยะบูรณาการในการดูแลสุขภาพ (I4Health) (University College London)
  • ศูนย์วิทยาศาสตร์การแทรกแซงและศัลยกรรม Wellcome / EPSRC (Wellcome / Wellcome (WEISS) (University College London)
  • โรงเรียนวิศวกรรมชีวการแพทย์และวิทยาศาสตร์การถ่ายภาพ (BMEIS) (King's College London)

เริ่มต้น

ดูการเริ่มต้นสำหรับคำแนะนำในการติดตั้งและสวัสดีโลก! ตัวอย่าง.

ตัวอย่างการใช้งานที่ยาวขึ้นสามารถพบได้ในบทช่วยสอน

เอกสารทั้งหมดถูกโฮสต์บนอ่านเอกสาร

กรุณาเปิดปัญหาใหม่หากคุณคิดว่ามีบางอย่างขาดหายไป

ผู้มีส่วนร่วม

ขอบคุณไปทุกคน (คีย์อิโมจิ):


Fernando Pérez-García

ความเป็นพาหะ
- - -
ชาว Gfabien
- -
g.reguig

Niels Schurink

Ibrahim Hadzic
-
การพ่นใหม่
-

Julian Klug
-
David Völgyes
-
Jean-Christophe Fillion-Robin

Suraj Pai
-
เบ็นดาร์วิน
-
Oeslle Lucena
-
Soumick Chatterjee

การไหลของเซลล์ประสาท

Jan Witowski

Derk Mus
-
Christian Herz
-
Cory efird
-
Esteban Vaca C.
-
เรย์ Phan
-

Akis Linardos
-
Nina Montana-Brown
-
Fabien-Brulport
-
malteekj
-
Andres Diaz-Pinto
-
Sarthak Pati
-
Gabriellakamlish
-

Tyler Spears
-
คำสั่ง

Xiangyu Zhao
-
Siahuat0727
-
svdvoort

Albans98

Matthew T. Warkentin

glupol
-
Ramonemiliani93
-
Justus Schock
- - -
Stefan Milorad Radonjić
-
Sajan Gohil
-
Ikko Ashimine

laynr

Omar U. Espejel
-
เจมส์บัตเลอร์
-
Res191
-
Nengwp
-
Susanveraclarke
-
เนเปิร์ด
-
เซบาสเตียนเพนนี
-

ใหญ่
-
DženanZukić
-
vasl12
?
François Rousseau
-
คนขี้เกียจ

Jacob Reinhold

Hsu
-

snipdome
-
อย่างมีรอย
-
คนกิน
-
Ayedsamy
-
J. Miguel Valverde
- -
José Guilherme Almeida
-
Asim Usman
-

CBRI92
-
Markus J. Ankenbrand
-
Ziv Yaniv

Luca Lumetti

chagelo
-
Mueller-Franzes
-
Abdelwahab Kawafi
-

Arthur Masson
-
양현식

Nicoloesch
-
Amund Vedal

ชาวอลาบามางัน
-
sbdoherty

Zhack47
-

เบลคดิวอี้

Doyeon Kim
-
Konomaxi
-
Laurent Chauvin
-
บานพับคริสเตียน
-
zzz123xyz
-
อามินอาลัม

Marius-SM
-
Haarisr

Chris Winder
-
Ricky Walsh

Keerthi Sravan Ravi
-

โครงการนี้เป็นไปตามข้อกำหนดทั้งหมดของผู้เข้าร่วม การมีส่วนร่วมทุกชนิดยินดีต้อนรับ!

ขยาย
ข้อมูลเพิ่มเติม
แอปที่เกี่ยวข้อง
แนะนำสำหรับคุณ
ข้อมูลที่เกี่ยวข้อง ทั้งหมด