scib reproducibility

scIB Воспроизводимость

Этот репозиторий содержит дополнительный код для воспроизведения анализа, представленного в документе по сравнительному анализу интеграции отдельных ячеек. Другие части проекта scIB можно найти в этих репозиториях:

• пакет scIB
• конвейер scIB
• Данные, использованные в исследовании

Некоторые дополнительные результаты можно просмотреть на веб-сайте результатов по адресу https://theislab.github.io/scib-reproducibility.

Структура каталогов

• data/ — файлы данных с результатами сравнительного анализа, используемые для создания цифр и веб-сайта с результатами.
• docs/ — веб-сайт с визуализированными результатами
• notebooks/ — блокноты Jupyter, используемые для подготовки наборов оценочных данных и показателей.
• scripts/ - Дополнительный код анализа
• visualization/ — Код для генерации рисунков и визуализаций
• website/ — Код для генерации результатов сайта