scib reproducibility

scIBの再現性

このリポジトリには、単一セル統合ベンチマーク ペーパーで提示された分析を再現するための補足コードが含まれています。 scIB プロジェクトの他の部分については、次のリポジトリを参照してください。

• scIBパッケージ
• scIBパイプライン
• 研究で使用されたデータ

一部の補足結果は、結果 Web サイト (https://theislab.github.io/scib-reproducibility) で参照できます。

ディレクトリ構造

• data/ - 数値および結果 Web サイトの作成に使用されるベンチマーク結果を含むデータ ファイル
• docs/ - レンダリング結果の Web サイト
• notebooks/ - 評価データセットとメトリクスの準備に使用される Jupyter ノートブック
• scripts/ - 追加の分析コード
• visualization/ - 図と視覚化を生成するコード
• website/ - 結果の Web サイトを生成するコード