scib reproducibility

scIB Reproduksibilitas

Repositori ini berisi kode tambahan untuk mereproduksi analisis yang disajikan dalam makalah benchmarking integrasi sel tunggal. Untuk bagian lain dari proyek scIB, lihat repositori berikut:

• paket scIB
• pipa scIB
• Data yang digunakan dalam penelitian

Beberapa hasil tambahan dapat dilihat di situs web hasil di https://theislab.github.io/scib-reproducibility.

Struktur direktori

• data/ - File data dengan hasil benchmarking yang digunakan untuk membuat gambar dan website hasil
• docs/ - Situs web hasil yang diberikan
• notebooks/ - Notebook Jupyter yang digunakan untuk menyiapkan kumpulan data dan metrik evaluasi
• scripts/ - Kode analisis tambahan
• visualization/ - Kode untuk menghasilkan gambar dan visualisasi
• website/ - Kode untuk menghasilkan situs web hasil