Unet Segmentation Pytorch Nest of Unets Download - Unet Segmentation Pytorch Nest of Unets Source Code Download

Unet Segmentation Pytorch Nest of Unets

ular piton

1.0.0

Unduh

Unet-semmentation-pytorch-sarang unat

Implementasi berbagai jenis model UNET untuk segmentasi gambar

Unet - u -net: jaringan konvolusional untuk segmentasi gambar biomedis https://arxiv.org/abs/1505.04597
RCNN-UNET -Jaringan saraf konvolusional residu berulang berdasarkan U-Net (R2U-net) untuk segmentasi gambar medis https://arxiv.org/abs/1802.06955
Perhatian UNET - Perhatian U -Net: Belajar di mana mencari pankreas https://arxiv.org/abs/1804.03999
RCNN-ATENSI UNET -PERHATIAN R2U-NET: Just Integration dari dua karya canggih baru-baru ini (R2U-net + Attention U-Net)

Nested UNET - UNET ++: Arsitektur U -Net bersarang untuk segmentasi gambar medis https://arxiv.org/abs/1807.10165

Dengan visualisasi lapisan

1. Memulai

Kloning repo:

git clone https://github.com/bigmb/Unet-Segmentation-Pytorch-Nest-of-Unets.git

2. Persyaratan

 python>=3.6
torch>=0.4.0
torchvision
torchsummary
tensorboardx
natsort
numpy
pillow
scipy
scikit-image
sklearn

Instal semua perpustakaan dependen:

pip install -r requirements.txt

3. Jalankan file

Tambahkan semua folder Anda ke baris ini 106-113

 t_data = '' # Input data
l_data = '' #Input Label
test_image = '' #Image to be predicted while training
test_label = '' #Label of the prediction Image
test_folderP = '' #Test folder Image
test_folderL = '' #Test folder Label for calculating the Dice score

4. Jenis yang tidak dikeluarkan

Tidak ada UNET1

Rcnn unet r2unet

Perhatian tidak ada att-unet

Perhatian-rcnn unet att-r2u

Bersarang Unet

bersarang

5. Visualisasi

Untuk merencanakan kerugian, Visdom akan diperlukan. Kode sudah ditulis, hanya membatalkan komentar bagian yang diperlukan. Aliran gradien juga dapat digunakan. Diambil dari (https://discuss.pytorch.org/t/check-gradient-flow-in-network/15063/10)

Folder model dibuat dan semua data disimpan di dalamnya. Lapisan terakhir akan disimpan di folder model. Jika diperlukan lapisan tertentu, sebutkan di baris 361.

VISULASI LAYER

Visulisisasi Filter

filt1

Tensorboardx masih harus mengubah beberapa parameter untuk mendapatkan visualisasi. Telah mengacaukan ini mencoba membuat Pytorch 1.1.0 bekerja dengan Tensorboard secara langsung (dan kemudian mengetahui saat ini itu tidak mendukung apa pun selain dari grafik linier)

Input Visulisisasi Gambar untuk Memeriksa

a) Gambar asli

b) Gambar Centercrop

6. Hasil

Skor DICE untuk Segmentasi Hippocampus Dataset Adni-Loni

7. Kutipan

Jika Anda menemukan itu berguna untuk pekerjaan Anda.

 @article{DBLP:journals/corr/abs-1906-07160,
  author    = {Malav Bateriwala and
               Pierrick Bourgeat},
  title     = {Enforcing temporal consistency in Deep Learning segmentation of brain
               {MR} images},
  journal   = {CoRR},
  volume    = {abs/1906.07160},
  year      = {2019},
  url       = {http://arxiv.org/abs/1906.07160},
  archivePrefix = {arXiv},
  eprint    = {1906.07160},
  timestamp = {Mon, 24 Jun 2019 17:28:45 +0200},
  biburl    = {https://dblp.org/rec/bib/journals/corr/abs-1906-07160},
  bibsource = {dblp computer science bibliography, https://dblp.org}
}