brainways
v0.1.15
Brainways เป็นเครื่องมือที่ใช้ AI สำหรับการลงทะเบียนอัตโนมัติปริมาณและการสร้างเครือข่ายกิจกรรมทั่วสมองโดยใช้ฟลูออเรสเซนต์ในชิ้นโคโรนา
การลงทะเบียนชิ้น Coronal การหาปริมาณของเซลล์และการวิเคราะห์ความคมชัดของสมองทั้งหมดระหว่างเงื่อนไขการทดลองควรเข้าถึงได้ง่ายจากซอฟต์แวร์เดียวโดยไม่ต้องใช้ประสบการณ์การเขียนโปรแกรม การปรับแต่งควรทำได้ง่ายโดยมีแบ็กเอนด์ Pythonic ที่มีความยืดหยุ่นสูง
ในการติดตั้งและเรียกใช้การใช้สมองให้เรียกใช้สิ่งต่อไปนี้ในสภาพแวดล้อม Python ของคุณ:
pip install brainways
brainways uiทำตามคำแนะนำการเริ่มต้นใช้งานของเราสำหรับรายละเอียดเพิ่มเติม
Brainways ช่วยให้ผู้ใช้สามารถลงทะเบียนปริมาณและให้การวิเคราะห์ความคมชัดทางสถิติโดยทำตามขั้นตอนง่าย ๆ หลายขั้นตอน:
การใช้งาน Brianways ถูกนำมาใช้เป็นสามโมดูล brainways.ui มีการใช้งาน GUI เป็นปลั๊กอิน Napari brainways.ui กำลังใช้ brainways เป็นแบ็กเอนด์ ฟังก์ชั่นทั้งหมดถูกนำไปใช้ในแพ็คเกจ Brainways การแยกนี้ทำขึ้นเพื่อรับประกันว่า Brainways เป็นซอฟต์แวร์ Gui-Agnostic และสามารถเข้าถึงได้อย่างเต็มที่และจัดการผ่านรหัส Python เพื่อให้สถานการณ์การใช้งานที่ซับซ้อนแบบกำหนดเอง รหัสที่ใช้ในการฝึกอบรมประเมินและเรียกใช้โมเดลการลงทะเบียนอัตโนมัติอยู่ใน brainways-reg-model
Brianways กำลังได้รับการพัฒนาอย่างแข็งขันโดย Ben Kantor จาก Bartal Lab, Tel Aviv University ประเทศอิสราเอล การเผยแพร่ของเราสามารถพบได้ที่นี่
หากคุณใช้สมองโปรดอ้างอิง Kantor และ Bartal (2023):
@article{kantor2023brainways,
title={Brainways: An Open-Source AI-based Software For Registration and Analysis of Fluorescent Markers on Coronal Brain Slices},
author={Kantor, Ben and Ben-Ami Bartal, Inbal},
journal={bioRxiv},
pages={2023--05},
year={2023},
publisher={Cold Spring Harbor Laboratory}
}
แจกจ่ายภายใต้เงื่อนไขของใบอนุญาต GNU GPL v3.0 "Brianways" เป็นซอฟต์แวร์ฟรีและโอเพ่นซอร์ส
หากคุณพบปัญหาใด ๆ โปรดยื่นปัญหาพร้อมกับคำอธิบายโดยละเอียด
