rdkit pypi

Rdkit Python Wheels

Этот репозиторий удерживает код для создания колеса платформы RDKIT для Linux, MacOS и Windows на GitHub Action и Circle CI. Колеса содержат скомпилированные динамические библиотеки, специфичные для платформы ( *.so , *.dylib и *.dll ) и доступны в PYPI. Rdkit можно легко установить с помощью

pip install rdkit

Примечание. Старые версии RDKIT могут быть доступны в репозитории rdkit-pypi PYPI ( pip install rdkit-pypi ). rdkit-pypi -старое имя этого проекта в PYPI. Будущие версии RDKIT будут доступны в репозитории rdkit PYPI. Пожалуйста, обновите свои зависимости, то есть измените rdkit-pypi на rdkit .

Пожалуйста, откройте проблему, если вы обнаружите, что чего -то не хватает или не работает, как и ожидалось.

Доступные сборки

ОС	Архи	Кусочек	Условия	3.8	3.9	3.10	3.11	3.12	CI
Linux	Intel	64	Glibc> = 2,28 (например, Ubuntu 18,04+, Centos 6+, ...)	Последний: 2024.3.5	✔	✔	✔	✔	Действия GitHub
Linux	Aarch64	64	Glibc> = 2,28 (например, Raspberry Pi, ...)	Последний: 2024.3.5	✔	✔	✔	✔	Круг CI
macOS	Intel	64	> = macOS 10.13	Последний: 2024.3.5	✔	✔	✔	✔	Действия GitHub
macOS	ARMV8	64	> = macOS 11, оборудование M1	Последний: 2024.3.5	✔	✔	✔	✔	Действия GitHub
Окна	Intel	64		Последний: 2024.3.5	✔	✔	✔	✔	Действия GitHub

Установка

Пип

python -m pip install rdkit
python -c " from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1'))) "

Поэзия

poetry add rdkit
poetry run python -c " from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1'))) " 

Локальные сборки на Linux

cibuildwheel требует patchelf ( apt install patchelf )

python3 -m pip install cibuildwheel

git clone https://github.com/kuelumbus/rdkit-pypi.git
cd rdkit-pypi

CIBW_BUILD=cp39-manylinux_x86_64 python3 -m cibuildwheel --platform linux --output-dir wheelhouse --config-file pyproject.toml

Замените cp39-manylinux_x86_64 на cp310-manylinux_x86_64 , cp311-manylinux_x86_64 , или cp312-manylinux_x86_64 чтобы построить для разных питона