rdkit pypi

Roda RDKit Python

Repositori ini memegang kode untuk membangun roda platform RDKIT untuk Linux, MacOS, dan Windows on Github Action dan Circle CI. Roda berisi pustaka dinamis khusus platform yang dikompilasi ( *.so , *.dylib , dan *.dll ) dan tersedia di PYPI. RDKIT dapat dengan mudah diinstal menggunakan

pip install rdkit

CATATAN: Versi RDKIT yang lebih lama mungkin tersedia di repositori rdkit-pypi PYPI ( pip install rdkit-pypi ). rdkit-pypi adalah nama lama dari proyek ini di PYPI. Versi RDKit di masa depan akan tersedia di repositori rdkit PYPI. Harap perbarui dependensi Anda, yaitu, ubah rdkit-pypi ke rdkit .

Harap buka masalah jika Anda menemukan sesuatu yang hilang atau tidak berfungsi seperti yang diharapkan.

Build yang tersedia

Os	Lengkungan	Sedikit	Kondisi	3.8	3.9	3.10	3.11	3.12	Ci
Linux	intel	64	GLIBC> = 2.28 (misalnya, Ubuntu 18.04+, Centos 6+, ...)	Terakhir: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Tindakan GitHub
Linux	aarch64	64	GLIBC> = 2.28 (misalnya, Raspberry Pi, ...)	Terakhir: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Lingkaran CI
MacOS	intel	64	> = MacOS 10.13	Terakhir: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Tindakan GitHub
MacOS	ARMV8	64	> = MacOS 11, perangkat keras M1	Terakhir: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Tindakan GitHub
Windows	intel	64		Terakhir: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Tindakan GitHub

Instalasi

Pip

python -m pip install rdkit
python -c " from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1'))) "

Puisi

poetry add rdkit
poetry run python -c " from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1'))) " 

Bangunan lokal di Linux

cibuildwheel membutuhkan patchelf ( apt install patchelf )

python3 -m pip install cibuildwheel

git clone https://github.com/kuelumbus/rdkit-pypi.git
cd rdkit-pypi

CIBW_BUILD=cp39-manylinux_x86_64 python3 -m cibuildwheel --platform linux --output-dir wheelhouse --config-file pyproject.toml

Ganti cp39-manylinux_x86_64 dengan cp310-manylinux_x86_64 , cp311-manylinux_x86_64 , atau cp312-manylinux_x86_64 untuk dibangun untuk python yang berbeda python yang berbeda