rdkit pypi

Rodit Python Wheels

Este repositório mantém o código para criar rodas de plataforma RDKit para Linux, MacOS e Windows no Github Action e Circle CI. As rodas contêm as bibliotecas dinâmicas específicas da plataforma compiladas ( *.so , *.dylib e *.dll ) e estão disponíveis no PYPI. Rdkit pode ser facilmente instalado usando

pip install rdkit

Nota: As versões mais antigas do RDKIT podem estar disponíveis no repositório rdkit-pypi PYPI ( pip install rdkit-pypi ). rdkit-pypi é o nome antigo deste projeto na Pypi. As versões futuras do RDKIT estarão disponíveis no repositório rdkit PYPI. Atualize suas dependências, ou seja, altere rdkit-pypi para rdkit .

Por favor, abra um problema se encontrar algo faltando ou não funcionando como esperado.

Construções disponíveis

OS	Arco	Pedaço	Condições	3.8	3.9	3.10	3.11	3.12	CI
Linux	Intel	64	glibc> = 2,28 (por exemplo, Ubuntu 18.04+, Centos 6+, ...)	Último: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Ações do GitHub
Linux	AARCH64	64	glibc> = 2,28 (por exemplo, Raspberry Pi, ...)	Último: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	CIRCLE CI
macos	Intel	64	> = MacOS 10.13	Último: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Ações do GitHub
macos	ARMV8	64	> = MacOS 11, hardware M1	Último: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Ações do GitHub
Windows	Intel	64		Último: 2024.3.5	✔️	✔️	✔️	✔️	Ações do GitHub

Instalação

Pip

python -m pip install rdkit
python -c " from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1'))) "

Poesia

poetry add rdkit
poetry run python -c " from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1'))) " 

Construções locais no Linux

cibuildwheel Requer patchelf ( apt install patchelf )

python3 -m pip install cibuildwheel

git clone https://github.com/kuelumbus/rdkit-pypi.git
cd rdkit-pypi

CIBW_BUILD=cp39-manylinux_x86_64 python3 -m cibuildwheel --platform linux --output-dir wheelhouse --config-file pyproject.toml

Substitua cp39-manylinux_x86_64 com cp310-manylinux_x86_64 , cp311-manylinux_x86_64 ou cp312-manylinux_x86_64 para construir para diferentes python