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workflowr

웹사이트 데이터

workflowr 1.7.1

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Workflowr : 조직 + 재현 가능한 + 공유 가능한 데이터 과학

Workflowr R 패키지는 연구원들이 효과적인 프로젝트 관리, 재현성, 협업 및 결과 공유를 촉진하는 방식으로 분석을 구성 할 수 있도록 도와줍니다. Workflowr은 문맹 프로그래밍 (KNITR 및 RMARKDOWN)과 버전 제어 (GIT, GIT2R)를 결합하여 타임 스탬프, 버전 및 문서화 된 결과가 포함 된 웹 사이트를 생성합니다. 모든 사용자는 워크 플로를 빠르고 쉽게 채택 할 수 있습니다.

자세한 내용은 온라인 문서를 참조하십시오. 예를 들어, Divvy Data Exploration Project를 참조하십시오. Workflowr가 촉진하는 재현 가능한 연구 프로젝트를 탐색하려면 Workflowr.io에 등록 된 프로젝트를 찾아보십시오. 최신 워크 플로우 개발에 대한 최신 정보를 유지하려면 Workflowr-Annount Mailing List (저용량, 읽기 전용)에 가입하십시오. 버그 보고서, 기능 요청 및 질문은 문제를여십시오.

특징
설치
빠른 시작
속성
기여

특징

조직
- 조직화 된 하위 디렉토리와 함께 프로젝트 템플릿을 제공합니다
- 코드와 결과를 R 마크 다운과 혼합합니다
- GIT를 사용하여 소스 코드와 결과를 모두 버전으로 사용합니다
재생할 수 있는
- 각 결과를 생성하는 데 사용되는 코드 버전을 표시합니다
- 격리 된 R 세션에서 각 분석을 실행합니다
- 각 분석의 세션 정보를 기록합니다
- 각 분석에 대해 무작위 숫자 생성에 대해 동일한 시드를 설정합니다.
공유 가능
- 연구 결과를 발표 할 웹 사이트를 만듭니다
- 문서 GitHub 페이지 또는 gitlab 페이지를 통해 웹 사이트를 무료로 호스팅하는 방법
- 과거 버전의 결과에 대한 링크를 만듭니다

Workflowr 웹 사이트를 실제로 보려면이 비디오 데모를 참조하십시오.

관련 도구는 R-Project-Workflows를 참조하십시오.

설치

r을 설치하십시오
- (권장) Rstudio를 설치하십시오
- (선택 사항) Pandoc 설치 (지침)
- (선택 사항) Git을 설치하십시오
Cran에서 Workflowr 설치 :
```
install.packages( " workflowr " )
```
github 또는 gitlab에 계정을 만듭니다

빠른 시작

 library("workflowr")

# Configure Git (only need to do once per computer)
wflow_git_config(user.name = "Full Name", user.email = "email@domain")

# Start a new workflowr project
wflow_start("myproject")

# Build the site
wflow_build()

# Customize your site!
#   1. Edit the R Markdown files in analysis/
#   2. Edit the theme and layout in analysis/_site.yml
#   3. Add new or copy existing R Markdown files to analysis/

# Preview your changes
wflow_build()

# Publish the site, i.e. version the source code and HTML results
wflow_publish("analysis/*", "Start my new project")

다음 단계 :

온라인에서 결과를 공유하는 방법을 배우려면 시작 Getting Vignette를 읽으십시오. 또는 재현 가능한 연구 워크숍 비네팅을 읽을 수 있습니다. 동일한 단계를 다루지 만 Workflowr의 재현성 기능을 보여주는 예제 코드 및 데이터를 포함합니다.
연구 웹 사이트를 사용자 정의하는 방법에 대한 아이디어에 대한 사용자 정의 비네팅을 읽으십시오.
Workflowr을 기존 프로젝트에 통합하는 방법에 대한 마이그레이션 비네팅을 읽으십시오.

속성

Workflowr는 시카고 대학교의 Matthew Stephens 실험실의 박사후 연구원 인 John Blischak에 의해 개발되었으며 유지되었습니다. 그는 Gordon과 Betty Moore Foundation에서 MS에 대한 보조금으로 자금을 지원받습니다. Peter Carbonetto와 Matthew Stephens는 공동 저자입니다.

우리는 패키지 개선을 돕는 워크 플로우 기고자들에게 매우 감사합니다. 또한 워크 플로우 사용자가 패키지 테스트 및 피드백을 제공해 주셔서 감사합니다.

Workflowr 패키지는 많은 훌륭한 오픈 소스 패키지를 사용합니다. 이 프로젝트에는 특히 R 패키지 Git2r, Knitr 및 Rmarkdown이 중요합니다. Workflowr 패키지가 어떻게 작동하는지 Vignette를 참조하십시오. 워크 플로우를 가능하게하는 소프트웨어에 대해 배우십시오.

Workflowr는 MIT 라이센스에 따라 제공됩니다. 적절한 귀속은 소프트웨어를 설명하는 원고를 인용하십시오.

Blischak JD, Carbonetto P 및 Stephens M. 재현 가능한 연구 코드 작성 및 공유 Workflowr Way [버전 1; 동료 검토 : 3 승인]. F1000Research 2019, 8 : 1749 (https://doi.org/10.12688/f1000research.20843.1)

Bibtex 항목을 얻으려면 citation("workflowr") 실행하십시오. F1000Research는 원래 버전뿐만 아니라 개정판도 게시합니다. 최신 버전을 확인하려면 종이의 URL로 이동하십시오.