multiarm
1.0.0
يوفر multiarm وظائف للمساعدة في تصميم تجارب سريرية متعددة الأسلحة متعددة المراحل. في كلتا الحالتين ، تسمح الوظائف المتاحة بتحديد حجم العينة ، ومحاكاة التجارب ، وحساب خاصية التشغيل التحليلي ، وإنتاج العديد من المؤامرات المفيدة.
لاحظ أن واجهة مستخدم رسومية لامعة R متاحة أيضًا لتصميم تجارب مرحلة واحدة ؛ يمكن الوصول إليها داخل R باستخدام multiarm::gui() ، أو عبر الإنترنت على https://mjgrayling.shinyapps.io/multiarm. يمكن العثور على معلومات إضافية حول هذا التطبيق في Grayling و Wason (2020).
يمكنك تثبيت أحدث إصدار من multiarm من GitHub مع:
devtools :: install_github( " mjg211/multiarm " ) يمكن العثور على مثال تمهيدي على كيفية الاستفادة من بعض الوظائف الأساسية للحزمة أدناه. يتوفر دعم أكثر تفصيلاً ، لتصميمات المرحلة الواحدة ، في المقالة المقالة القصيرة ، والتي يمكن الوصول إليها باستخدام vignette("single_stage", package = "multiarm") . انظر أيضا Grayling و Wason (2020). لمزيد من المساعدة ، يرجى البريد الإلكتروني [email protected].
في المجموع ، 46 وظيفة متوفرة حاليا. إن اتفاقيات التسمية الخاصة بهم هي بحيث يتم ربط العديد من سلاسل الشخصيات معًا ، مفصولة بسد. تشير السلسلة الأولى إلى الغرض من الوظيفة (أي نوع الحساب الذي يقوم به):
build_###_###() : بناء كائنات تصميم تجريبية متعددة الأسلحة ، مثل تلك التي تم إرجاعها بواسطة وظائف des_###_###() . للاستخدام عندما يكون تصميم معين مهم.des_###_###() : حدد حجم العينة المطلوب بنوع معين من تصميم التجارب السريرية متعددة الأسلحة.gui() : يوفر واجهة مستخدم رسومية لتصميم تحديد.opchar_###_###() : تحديد خصائص التشغيل (الطاقة ، وحدات الأخطاء الحكيمة للعائلة ، وما إلى ذلك) لتصميم تجريبي متعدد الأسلحة ، عبر التكامل الطبيعي متعدد المتغيرات.plot.multiarm_des_###_###() : إنتاج مخططات مفيدة (الطاقة ، منحنيات معدل الاكتشاف الخاطئة ، إلخ) المتعلقة بتصميم تجريبي متعدد الأسلحة متوفر.sim_###_###() : تقدير تجريبيًا لخصائص التشغيل (القوة ، ونصف الأخطاء الحكيمة للعائلة ، وما إلى ذلك) لتصميم تجريبي متعدد الأسلحة ، عبر المحاكاة.والثاني يشير إلى التصميم:
###_dtl_###() : تتعلق بتصميمات قطرة متعددة المراحل. انظر ، على سبيل المثال ، Wason et al (2017).###_gs_###() : تتعلق بتصميمات متعددة المراحل متعددة المراحل المتعددة الأسلحة. انظر ، على سبيل المثال ، Magirr et al (2012).###_ss_###() : تتعلق بتصميمات مرحلة واحدة. انظر ، على سبيل المثال ، Grayling و Wason (2020).والثالث يشير إلى نوع النتيجة التي هي الوظيفة من أجل:
###_###_bern() : افترض أن النتيجة الأولية الموزعة ببرنولي.###_###_norm() : افترض أن النتيجة الأولية الموزعة عادة.###_###_pois() : افترض أن النتيجة الأولية الموزعة Poisson. عادةً ما يتم استخدام وظيفة des_###_###() أولاً لتحديد تصميم لمعلمات التجربة ذات الاهتمام. على سبيل المثال ، فكر في تصميم تجربة مرحلة واحدة لـ:
K ).alpha correction ).beta ، delta1 ، power ).sigma ).ratio ).لحساب التصميم ، سنقوم بتشغيل:
des <- des_ss_norm( K = 3 ,
alpha = 0.05 ,
beta = 0.2 ,
delta1 = 1 ,
sigma = rep( 1 , 4 ),
ratio = rep( 1 , 3 ),
correction = " dunnett " ,
power = " marginal " )ثم ، إجمالي حجم العينة المطلوب هو:
des $ N
# > [1] 67.42534بالإضافة إلى ذلك ، يمكن الوصول إلى خصائص التشغيل تحت الفارغ العالمي ، البديل العالمي ، وكل من التكوينات الأقل ملاءمة ، مع:
des $ opchar
# > # A tibble: 5 x 20
# > tau1 tau2 tau3 Pdis Pcon P1 P2 P3 FWERI1 FWERI2 FWERI3
# > <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
# > 1 0 0 0 0.0501 0.00109 0.0196 0.0196 0.0196 0.0501 0.00774 0.00109
# > 2 1 1 1 0.950 0.611 0.800 0.800 0.800 0 0 0
# > 3 1 0 0 0.800 0.00330 0.800 0.0196 0.0196 0.0360 0.00330 0
# > 4 0 1 0 0.800 0.00330 0.0196 0.800 0.0196 0.0360 0.00330 0
# > 5 0 0 1 0.800 0.00329 0.0196 0.0196 0.800 0.0360 0.00330 0
# > # … with 9 more variables: FWERII1 <dbl>, FWERII2 <dbl>, FWERII3 <dbl>,
# > # PHER <dbl>, FDR <dbl>, pFDR <dbl>, FNDR <dbl>, Sens <dbl>, Spec <dbl> يمكن أيضًا إنتاج مؤامرات مفيدة باستخدام plot.multiarm_des_ss_norm() على النحو التالي:
plot( des )
Grayling MJ ، Wason JMS (2020) تطبيق ويب لتصميم التجارب السريرية متعددة الأسلحة. BMC Cancer 20:80. doi: 10.1186/s12885-020-6525-0. بميد: 32005187.
Magirr D ، Jaki T ، Whitehead J (2012) اختبار Dunnett المعمم للدراسات السريرية متعددة المراحل متعددة المراحل مع اختيار العلاج. Biometrika 99 (2): 494–501. doi: 10.1093/biomet/ass002.
Wason J ، Stallard N ، Bowden J ، Jennison C (2017) تصميم متعدد المراحل للمرورات للتجارب السريرية متعددة الأسلحة. Stat Meth Med Res 26 (1): 508–524. doi: 10.1177/0962280214550759. بميد: 25228636.
