ALSA

Алгоритмы для анализа секвенирования

Репозиторий содержит внедрение Python алгоритмов анализа секвенирования следующего поколения.

Алгоритм	Сценарий
Наивный алгоритм	naive_pattern_match.py
Ахо-корасик алгоритм	ahocorasick.py
Обратный нетерминированный алгоритм сопоставления DAWG	Bndm.py
Максимальные уникальные матчи	мама
Построить массив суффиксов	Sais.py