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シーケンス分析のためのアルゴリズム

リポジトリには、コアの次世代シーケンス分析アルゴリズムのPython実装が含まれています。

アルゴリズムスクリプト
ナイーブアルゴリズムnaive_pattern_match.py
Aho-CorasickアルゴリズムAhocorasick.py
後方の非決定的DAWGマッチングアルゴリズムbndm.py
最大の一意の一致mum.py
接尾辞アレイの構築sais.py
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