semrep

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Titre du projet

Vérification de la factualité des prédications SEMREP

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Description

Le projet traite d'un modèle de langue basé sur un transformateur pour filtrer les prédications appartenant au sous-ensemble suivant de prédicats de SEMMEDDB, appelé de manière informelle du groupe "Interactions de substances":

• Interacts_with
• Stimulation
• Inhiber

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Informations sur l'auteur

MD Rakibul Islam Prince Graduate Research Assistant Department of Electrical and Computer Engineering Indiana University-Purdue University Indianapolis Courriel: [email protected]

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Installation du package

Pour reproduir les résultats au début, tous les packages nécessitant la nécessité sont nécessaires pour être installés. Le fichier YAML "SemRepenv.yml" résume l'environnement conda que j'ai utilisé.

courir

conda envate -f semrepenv.yml
conda activer SemRepenv
ou,
pip install -r exigences.txt

Pour installer l'environnement avant d'exécuter des scripts ou un ordinateur portable. Ou, vous pouvez installer manuellement les packages à partir du fichier "exigence.txt"

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Structure du projet et descriptions

/ semrep
├fiques / données
│ ├fiquesl
│ └fique
├fiques / journaux
│ ├── bert_logfile.log
│ ├fique
│ └fique
├fiques / modèles
│ ├── SEMREP_SIMPLE_BERT_MODEL
│ ├fique
│ └fique
├fiques / tracés
│ ├── bert_cat_arg_dis_impact_all.png
│ ├sé
│ ├fiques
│ ├fiques
│ ├fiques
│ ├fique
│ ├fique
│ ├fiques
│ ├fique
│ └fique
├fiques / résultats
│ ├fiques
│ ├fiques
│ ├── test_bert_results.csv
│ └fique
├── / src
│ ├fique
│ └fique
├fiques
├til les exigences.txt
└tilmet SemRepenv.yml

Vous trouverez ci-dessous un aperçu des fichiers et dossiers clés de ce projet:

• `Data / ': répertoire où les fichiers de données bruts et traités sont stockés.

• `data / substance_interactions.csv ': fichier de données brutes

• `data / substance_interactions_cleaned.csv ': fichier de données traité et nettoyant

• logs/ : répertoire contenant les journaux pour chaque modèle.

• logs/<model_name>_logfile.log : logfile pour modèle <Model_name>

• models/ : répertoire contenant les points de contrôle à finetumed des modèles.

• plots/ : répertoire contenant toutes les parcelles générées pendant l'analyse.

• results/ : Répertoire où les résultats du test et de la validation sont installés.

• src/ : répertoire contenant les cahiers et scripts du modèle.

• src/semrep_model.ipynb : Note à carbural détaillant l'implimentation complète du projet

• src/utils.py : scripts utilisés pour les tâches de visualisation d'analyse des données

• `Readme.txt ': fichier détaillant la description de la base de code.

• `exigence.txt ': Détails de fichiers Packages nécessaires.

• `SemRepenv.yml ': dossier pour recréer l'environnement.