Awesome Language Model on Graphs
1.0.0
根據我們的調查文件：圖表上的大語言模型：一項全面的調查，策劃了有關大語言模型（LLM）的論文和資源清單。
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大型語言模型（LLMS），例如Chatgpt和Llama，由於其強大的文本編碼/解碼能力以及新發現的新興能力（例如，推理），因此在自然語言處理方面創造了重大進步。儘管LLM的設計主要是為了處理純文本，但在許多真實世界的情況下，文本數據與圖形形式（例如，學術網絡和電子商務網絡）的豐富結構信息相關聯或圖形數據，其中圖形數據與豐富的文本信息（例如，分子與描述）相關。此外，儘管LLM已顯示出其純粹的基於文本的推理能力，但是否可以將這種能力推廣到圖形方案（即，基於圖形的推理）尚未得到充滿信心。在本文中，我們對與圖形上的大型語言模型相關的方案和技術進行了全面的綜述。
工作中使用的變壓器體系結構，例如，encoderonly，decoderonly，encoderDecoder。
大語言模型的大小，例如，介質（IE，小於1B參數），LLM（即，超過1B參數）。
統一大型語言模型和知識圖：路線圖。 preprint
Shirui Pan，Linhao Luo，Yufei Wang，Chen Chen，Jiapu Wang，Xindong Wu [PDF]，2023.6
將圖與大型語言模型集成：方法和前景preprint
Shirui Pan，Yizhen Zheng，Yixin Liu [PDF]，2023.10
邁向圖基礎模型：調查及其他。 preprint
Jiawei Liu，Cheng Yang，Zhiyuan Lu，Junze Chen，Yibo Li，Mengmei Zhang，Ting Bai，Yuan Fang，Lichao Sun，Philip S. Yu，Chuan Shi。 [PDF]，2023.10
圖表的調查符合大型語言模型：進度和未來方向。 preprint
Yuhan Li，Zhixun Li，Peisong Wang，Jia Li，Xiangguo Sun，Hong Cheng，Jeffrey Xu Yu。 [PDF]，2023.11
表3在我們的調查論文中，圖形上的大語言模型：全面的調查。
直接回答
語言模型可以解決自然語言的圖形問題嗎？ preprint
Heng Wang，Shangbin Feng，Tianxing HE，Zhaoxuan Tan，Xioochuang Han，Yulia Tsvetkov。 [PDF] [代碼]，2023.5，
GPT4Graph：大語言模型可以理解圖形結構化數據嗎？經驗評估和基準測試。 preprint
Jiayan Guo，Lun Du，Hengyu Liu，Mengyu Zhou，Xinyi He，Shi Han。 [PDF]，2023.5，
在圖表上評估大型語言模型：績效見解和比較分析。 preprint
Chang Liu，Bo Wu。 [PDF] [Code]，2023.8，[PDF]，2023.5，
像圖形一樣說話：編碼大型語言模型的圖形。 preprint
Bahare Fatemi，Jonathan Halcrow，Bryan Perozzi。 [PDF]，2023.10，
Graphllm：提高大語模型的圖形推理能力。 preprint
Ziwei Chai，Tianjie Zhang，Liang Wu，Kaiqiao Han，Xiaohai Hu，Xuanwen Huang，Yang Yang Yang Yang。 [PDF] [代碼]，2023.10，
LLM4DYG：大型語言模型可以在動態圖上解決問題嗎？ preprint
Zeyang Zhang，Xin Wang，Ziwei Zhang，Haoyang Li，Yijian Qin，Simin Wu，Wenwu Zhu [PDF] [Code]，2023.10，
我應該使用哪種方式 - 文本，主題或圖像？ ：使用大語言模型了解圖。 preprint
Debarati Das，Ishaan Gupta，Jaideep Srivastava，Dongyeop Kang [PDF] [Code]，2023.11，
GraphArena：在圖計算問題上對大語言模型進行基準測試。 preprint
Jianheng Tang，Qifan Zhang，Yuhan Li，Jia Li [PDF] [Code]，2024.7，
LLMS幻覺圖也：結構性的觀點。 preprint
Erwan Le Merrer，Gilles Tredan [PDF]，2024.9，
結構爭奪：大型語言模型的一般框架來推理結構化數據。 preprint
Jinhao Jiang，Kun Zhou，Zican Dong，Keming Ye，Wayne Xin Zhao，Ji-Rong Wen。 [PDF] [代碼]，2023.5，
思想掌握：知識圖上大語言模型的深層和負責任的推理。 preprint
Jiashuo Sun，Chengjin Xu，Lumingyuan Tang，Saizhuo Wang，Chen Lin，Yeyun Gong，Lionel M. Ni，Heung-Yeung Shum，Jian Guo。 [PDF] [代碼]，2023.7，
探索大型語言模型以在線工作建議中的圖形數據理解。 preprint
Likang Wu，Zhaopeng Qiu，Zhi Zheng，Hengshu Zhu，Engong Chen。 [PDF] [代碼]，2023.7，
知識圖提示了多文件問題回答。 AAAI2024
Yu Wang，Nedim Lipka，Ryan Rossi，Alex Siu，Ruiyi Zhang，Tyler Derr。 [PDF] [代碼]，2023.8，
Chatrule：使用大語言模型的挖掘邏輯規則用於知識圖理論。 preprint
Linhao Luo，Jiaxin JU，Bo Xiong，Yuan-Fang Li，Gholamreza Haffari，Shirui Pan。 [PDF] [代碼]，2023.9，
圖表上的推理：忠實且可解釋的大語言模型推理。 preprint
Linhao Luo，Yuan-Fang Li，Gholamreza Haffari，Shirui Pan。 [PDF] [代碼]，2023.10，
思想傳播：一種與大語言模型進行複雜推理的類似方法。 preprint
Junchi Yu，跑了，雷克斯·楊。 [PDF]，2023.10，
大型語言模型可以學習時間推理。 preprint
Siheng Xiong，Ali Payani，Ramana Kompella，Faramarz Fekri。 [PDF]，2024.1，
探索大語言模型中圖形推理的局限性。 preprint
Palaash Agrawal，Shavak Vasania，Cheston Tan。 [PDF]，2024.2，
在多模式大語言模型中用於圖形推理的圖形。 preprint
Yanbin Wei，Shuai Fu，Weisen Jiang，James T. Kwok，Yu Zhang。 [PDF]，2024.2，
異步計劃推理中的圖形增強大型語言模型。 preprint
Fangru Lin，Emanuele La Malfa，Valentin Hofmann，Elle Michelle Yang，Anthony Cohn，Janet B. Pierrehumbert。 [PDF]，2024.2，
大語言模型的微觀結構和圖形回憶的準確性。 preprint
Yanbang Wang，Hejie Cui，Jon Kleinberg。 [PDF]，2024.2，
結構引導提示：通過探索文本的圖形結構來指導多步推理中的大語言模型。 preprint
Kewei Cheng，Nesreen K. Ahmed，Theodore Willke，Yizhou Sun。 [PDF]，2024.2，
基礎結構：具有圖形理解和推理能力的大型語言模型。 preprint
Zihan Luo，Xiran Song，Hong Huang，Jianxun Lian，Chenhao Zhang，Jinqi Jiang，Xing Xie，Hai Jin。 [PDF]，2024.3，
必要時給我打電話：LLM可以有效而忠實地推理結構化的環境。 preprint
Sitao Cheng，Ziyuan Zhuang，Yong Xu，Fangkai Yang，Chaoyun Zhang，Xiaoting Qin，Xiang Huang，Ling Chen，Qingwei Lin，Dongmei Zhang，Saravan Zhang，Saravan Rajmohan，Qi Zhang，Qi Zhang。 [PDF]，2024.3，
探索大語模型在圖生成中的潛力。 preprint
楊Yao，Xin Wang，Zeyang Zhang，Yijian Qin，Ziwei Zhang，Xu Chu，Yuekui Yang，Wenwu Zhu，Hong Mei。 [PDF]，2024.3，
GearpinIght：在大語言模型中解鎖見解，以了解圖形結構。 preprint
Yukun Cao，Shuo Han，Zengyi Gao，Zezhong Ding，Xike Xie，S.Kevin Zhou。 [PDF]，2024.5，
大型語言模型可以分析專業人士等圖形嗎？基準，數據集和模型。 NeurIPS 2024
Xin Li，Weize Chen，Qizhi Chu，Haopeng Li，Zhaojun Sun，Ran Li，Chen Qian，Yiwei Wei，Zhiyuan Liu，Chuan Shi，Maosong Sun，Cheng Yang。 [PDF] [代碼] [模型和數據集]，2024.9，，
圖形線性化方法用於具有大語言模型的圖表上的推理。 preprint
Christos Xypolopoulos，Guokan Shang，Xiao Fei，Giannis Nikolentzos，Hadi Abdine，Iakovos Evdaimon，Michail Chatzianastasis，Giorgos Stamou，Michalis vazirgiannis。 [PDF]，2024.10，
GRS-QA-圖形結構化問題回答數據集。 preprint
Anish Pahilajani，Devasha Trivedi，Jincen Shuai，Khin S. Yone，Samyak Rajesh Jain，Namyong Park，Ryan A. Rossi，Nesreen K. Ahmed，Franck Dernoncourt，Yu Wang。 [PDF]，2024.11，
圖形-Toolformer：通過CHATGPT提示增強圖形推理能力的LLM能力。 preprint
Jiawei Zhang。 [PDF] [代碼]，2023.4，
圖鏈：通過在圖形上進行推理來增強大語言模型。 preprint
Bowen Jin，Chulin Xie，Jiawei Zhang，Kashob Kumar Roy，Yu Zhang，Suhang Wang，Yu Meng，Jiawei Han。 [PDF] [代碼] [數據]，2024.4，
從本地到全局：一種以查詢為中心的摘要的圖形抹布方法。 preprint
Darren Edge，Ha Trinh，Newman Cheng，Joshua Bradley，Alex Chao，Apurva Mody，Steven Truitt，Jonathan Larson。 [PDF]，2024.4，
大語模型是否圖形算法推理器？ preprint
亞歷山大·K·泰勒（Alexander K Taylor），安東尼·卡特魯弗（Anthony Cuturrofo），維沙爾·耶西什（Vishal Yathish），mingyu derek ma，wei wang。 [PDF] [代碼]，2024.10，
表7在我們的調查論文中，圖形上的大語言模型：全面的調查。
llm作為預測變量（節點）
匹配：大型層次結構中的元數據感知文本分類。 WWW 2021
Zhang，Zhihong Shen，Yuxiao Dong，Kuansan Wang，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2021.2，
QA-GNN：使用語言模型和知識圖的推理，以回答問題。 NAACL 2021
Michihiro Yasunaga，Hongyu Ren，Antoine Bosselut，Percy Liang，Jure Leskovec。 [PDF] [代碼]，2021.4，
自然語言都是圖形需求。 preprint
Ruosong Ye，Caiqi Zhang，Runhui Wang，Shuyuan Xu，Yongfeng Zhang。 [PDF]，2023.8，
LLM可以有效利用圖形結構信息：何時何地。 preprint
Jin Huang，Xingjian Zhang，Qiaozhu Mei，Jiaqi MA。 [PDF] [代碼]，2023.9，
圖形神經提示使用大型語言模型。 preprint
Yijun Tian，Huan Song，Zichen Wang，Haozhu Wang，Ziqing Hu，Fang Wang，Nitesh V. Chawla，Panpan Xu。 [PDF]，2023.9，
基於及時的節點提取器，用於在文本屬性圖上進行幾次學習。 preprint
Xuanwen Huang，Kaiqiao Han，Dezheng Bao，Quanjin Tao，Zhisheng Zhang，Yang Yang Yang，Qi Zhu。 [PDF]，2023.9，，
GraphText：文本空間中的圖形推理。 preprint
Jianan Zhao，Le Zhuo，Yikang Shen，Meng Qu，Kai Liu，Michael Bronstein，Zhaocheng Zhu，Jian Tang [PDF]，2023.10，
GraphGpt：大型語言模型的圖形指令調整。 preprint
Jiabin Tang，Yuhao Yang，Wei Wei，Lei Shi，Lixin SU，Suqi Cheng，Dawei Yin，Chao Huang。 [PDF]，2023.10，
使用一個文本編碼器在文本富裕網絡上學習多重嵌入。 preprint
Bowen Jin，Winao Zhang，Yu Zhang，Yu Meng，Han Zhao，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2023.10，
通過大型語言模型進行文本歸屬圖的大型語言模型學習。 preprint
Yijian Qin，Xin Wang，Ziwei Zhang，Wenwu Zhu。 [PDF]，2023.10，
推理：在預訓練的語言模型中啟用結構子圖推理，以回答知識圖。 EMNLP23
Jinhao Jiang，Kun Zhou，Wayne Xin Zhao，Yaliang Li，Ji-Rong Wen。 [PDF]，2023.12，
歷史鏈：與LLM的學習和預測有關時間知識圖的完成。 preprint
Ruilin Luo，Tianle Gu，Haoling Li，Junzhe Li，Zicheng Lin，Jiayi Li，Yujiu Yang。 [PDF] [代碼]，2024.1，
具有大型語言模型的大規模異構圖上的可擴展鏈路預測。 preprint
Baolong Bi，Shenghua Liu，Yiwei Wang，Lingrui Mei，Xueqi Chen。 [PDF]，2024.1，
基於相似性的鄰居選擇圖形LLMS。 preprint
Rui Li，Jiwei Li，Jiawei Han，Guoyin Wang。 [PDF]，2024.2，
讓您的圖表進行談話：編碼LLM的結構化數據。 preprint
Bryan Perozzi，Bahare Fatemi，Dustin Zelle，Anton Tsitsulin，Mehran Kazemi，Rami al-Rfou，Jonathan Halcrow。 [PDF]，2024.2，
指導圖：通過以圖形為中心的指令調整和偏好對齊來增強大型語言模型。 preprint
Jianing Wang，Junda Wu，Yupeng Hou，Yao Liu，Ming Gao，Julian McAuley。 [PDF]，2024.2，
圖形神經網絡增強了檢索，以回答LLM的問題。 preprint
Zijian Li，Qingyan Guo，Jiawei Shao，Lei Song，Jiang Bian，Jun Zhang，Rui Wang。 [PDF]，2024.6，
llms作為零拍圖學習者：與LLM令牌嵌入的GNN表示的對齊。 preprint
Duo Wang，Yuan Zuo，Fengzhi Li，Junjie Wu。 [PDF]，2024.8，
帶有圖形變壓器的知識圖的文本生成。 NAACL 2019
Rik Koncel-Kedziorski，Dhanush Bekal，Yi Luan，Mirella Lapata，Hannaneh Hajishirzi。 [PDF] [代碼]，2019.4，
GraphFormers：用於在文本圖上進行表示的GNN-NEST變形金剛。 NeurIPs 2021
Junhan Yang，Zheng Liu，Shitao Xiao，Chaozhuo Li，Defu Lian，Sanjay Agrawal，Amit Singh，Guangzhong Sun，Xing Xie。 [PDF] [代碼]，2021.5，
Greaselm：圖形推理增強的語言模型，以回答。 ICLR 2022
Xikun Zhang，Antoine Bosselut，Michihiro Yasunaga，Hongyu Ren，Percy Liang，Christopher D Manning和Jure Leskovec。 [PDF] [代碼]，2022.1，
異源：基於變壓器的深度節點表示在異質文本豐富的網絡上學習。 KDD 2023
Bowen Jin，Yu Zhang，Qi Zhu，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2022.5，
隱藏的模式網絡。 preprint
RamsésJ。Sánchez，Lukas Conrads，Pascal Welke，Kostadin Cvejoski，CésarOjeda。 [PDF]，2022.7，
龍：深度雙向語言知識圖。 NeurIPs 2022
Michihiro Yasunaga，Antoine Bosselut，Hongyu Ren，Xikun Zhang，Christopher D. Manning，Percy Liang，Jure Leskovec。 [PDF] [代碼]，2022.10，
EdgeFormers：用於在文本邊緣網絡上表示的表示圖形的變壓器。 ICLR 2023
Bowen Jin，Yu Zhang，Yu Meng，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2023.1，
Patton：在文本豐富的網絡上預處理語言模型。 ACL 2023
Bowen Jin，Winao Zhang，Yu Zhang，Yu Meng，Xinyang Zhang，Qi Zhu，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2023.5，
圖形語言模型。 preprint
莫里茨·普倫茨（Moritz Plenz），安妮特·弗蘭克（Anette Frank）。 [PDF]，2024.1，
在文本圖上對大型語言模型的有效調整和推斷。 preprint
Yun Zhu，Yaoke Wang，Haizhou Shi，Siliang Tang。 [PDF]，2024.1，
Hyperbert：將超圖感知層與文本屬性超圖上的節點分類的語言模型混合。 preprint
AdriánBazaga，PietroLiò，Gos Micklem。 [PDF]，2024.2，
將LLM的功率釋放為文本和圖形結構數據的多模式編碼器。 preprint
Jicheng Lin，Kun Qian，Haoyu Han，Nurendra Choudhary，Tianxin Wei，Zhongruo Wang，Sahika Genc，Edward W Huang，Sheng Wang，Karthik Subbian，Danai Koutra，Jimeng Sun.，Jimeng Sun. [PDF]，2024.10，
解釋科學文件之間的關係。 ACL 2021
Kelvin Luu，Xinyi Wu，Rik Koncel-Kedziorski，Kyle LO，Isabel Cachola，Noah A. Smith。 [PDF]，2020.2，
幽靈：使用引用信息變壓器的文檔級表示學習。 ACL 2020
Arman Cohan，Sergey Feldman，Iz Beltagy，Doug Downey，Daniel S. Weld。 [PDF]，2020.4，
臨時檢索的預培訓：您也需要超鏈接。 CIKM 2021
Zhengyi MA，Zhicheng Dou，Wei Xu，Xinyu Zhang，Hao Jiang，Zhao Cao，Ji-Rong Wen。 [PDF] [代碼]，2021.8，
帶有引文嵌入的科學文檔表示的鄰里對比學習。 EMNLP 2022
Malte Ostendorff，Nils Rethmeier，Isabelle Augenstein，Bela Gipp，Georg Rehm。 [PDF] [代碼]，2022.2，
元數據誘導的對比度學習，用於零拍的多標籤文本分類。 WWW 2022
Zhang，Zhihong Shen，Chieh-Han Wu，Boya Xie，Junheng Hao，Ye-Yi Wang，Kuansan Wang，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2022.2，
Linkbert：帶有文檔鏈接的語言預測模型。 ACL 2022
Michihiro Yasunaga，Jure Leskovec，Percy Liang。 [PDF] [代碼]，2022.3，
E2EG：使用圖形拓撲和基於文本的節點屬性的端到端節點分類。 ICDM 2023
Tu Anh Dinh，Jeroen Den Boef，Joran Cornelisse，Paul Groth。 [PDF]，2022.8，
Twhin-Bert：在Twitter上用於多語言推文表示的一種具有社會增益的預訓練的語言模型。 KDD 2023
Xinyang Zhang，Yury Malkov，Omar Florez，Serim Park，Brian McWilliams，Jiawei Han，Ahmed El-Kishky。 [PDF] [代碼]，2022.9，
TouchUp-G：通過以圖形為中心的登錄改進功能表示。 preprint
Jing Zhu，Xiang Song，Vassilis N. Ioannidis，Danai Koutra，Christos Falutsos。 [PDF]，2023.9，
Wikiformer：Wikipedia的結構化信息進行培訓，以進行臨時檢索。 preprint
Weihang Su，Qingyao ai，Xiangsheng Li，Jia Chen，Yiqun Liu，Xiaolong Wu，Shengluan Hou。 [PDF]，2023.12，
WalkLM：用於歸因圖嵌入的統一語言模型微調框架。 NeurIPs 2023
Yanchao Tan，Zihao Zhou，Hang LV，Weiming Liu，Carl Yang。 [PDF]，2023.12，
Glam：通過鄰里分區和生成子圖編碼的微型語言模型用於域知識圖形對齊。 AAAI 2024
Stefan Dernbach，Khushbu Agarwal，Alejandro Zuniga，Michael Henry，Sutanay Choudhury。 [PDF]，2024.2，
UNIGLM：培訓一種統一的語言模型，以供文本歸屬圖。 preprint 2024
Yi Fang，Dongzhe粉絲，Sirui Ding，Ninghao Liu，Qiaoyu tan。 [PDF]，2024.6，
GNN-LM：基於GNN的全局上下文的語言建模。 ICLR 2022
Yuxian Meng，Shi Zong，Xiaoya Li，Xiaofei Sun，Tianwei Zhang，Fei Wu，Jiwei li。 [PDF] [代碼]，2021.10，
節點特徵通過自我監督的多尺度鄰域預測提取。 ICLR 2022
Eli Chien，Wei-Cheng Chang，Cho-Jui Hsieh，Hsiang-Fu Yu，Jiong Zhang，Olgica Milenkovic，Inderjit S Dhillon。 [PDF] [代碼]，2021.11，
TextGnn：通過Graph Neural網絡在讚助搜索中改進文本編碼器。 WWW 2021
Jason Yue Zhu，Yanling Cui，Yuming Liu，Hao Sun，Xue Li，Markus Pelger，Tianqi Yang，Liangjie Zhang，Ruofei Zhang，Huasha Zhao。 [PDF] [代碼]，2022.1
ADSGNN：在讚助搜索中，行為圖增強了相關性建模。 SIGIR 2021
Chaozhuo Li，Bochen Pang，Yuming Liu，Hao Sun，Zheng Liu，Xing Xie，Tianqi Yang，Yanling Cui，Liangjie Zhang，Qi Zhang。 [PDF] [代碼]，2022.4
語言和圖形神經網絡模型的有效培訓。 AAAI 2023
Vassilis N Ioannidis，Xiang Song，Da Zheng，Houyu Zhang，Jun Ma，Yi Xu，Belinda Zeng，Trishul Chilimbi，George Karypis。 [PDF]，2022.6，
大圖語料庫上的圖形語言模型預訓練可以幫助多個圖形應用程序。 KDD 2023
Han Xie，Da Zheng，Jun Ma，Houyu Zhang，Vassilis N. Ioannidis，Xiang Song，Qing Ping，Sheng Wang，Carl Yang，Yi Xu，Belinda Zeng，Trishul Chilimbi。 [PDF]，2023.6，
探索大語模型（LLM）在圖形上學習的潛力。 preprint
Zhikai Chen，Haitao Mao，Hang Li，Wei Jin，Hongzhi Wen，Xioochi Wei，Shuaiqiang Wang，Dawei Yin，Wenqi Fan，Hui Liu，Jiliang Tang。 [PDF] [代碼]，2023.7，
Simteg：一種令人沮喪的簡單方法可改善文本圖學習。 preprint
Keyu Duan，Qian Liu，Tat-Seng Chua，Shuicheng Yan，Wei Tsang ooi，Qizhe Xie，Junxian He。 [PDF] [代碼]，2023.8，
作為特徵的解釋：基於LLM的文本屬性圖。 preprint
Xiaoxin He，Xavier Bresson，Thomas Laurent，Adam Perold，Yann Lecun，Bryan Hooi。 [PDF] [代碼]，2023.5，
具有大語言模型（LLMS）的圖表上的無標籤節點分類。 preprint
Zhikai Chen，Haitao Mao，Hongzhi Wen，Haoyu Han，Wei Jin，Haiyang Zhang，Hui Liu，Jiliang Tang。 [PDF]，2023.9，
使用大語言模型（LLM）授權文本屬性的圖形學習。 preprint
Jianxiang Yu，Yuxiang Ren，Chenghua Gong，Jiaqi Tan，Xiang Li，Xuecang Zhang。 [PDF]，2023.10，
大型語言模型作為拓撲結構增強器，用於文本歸屬圖。 preprint
Shengyin Sun，Yuxiang Ren，Chen MA，Xuecang Zhang。 [PDF]，2023.11，
一項關於文本屬性圖的綜合研究：基準測試和重新思考。 NeurIPS 2023
Hao Yan, Chaozhuo Li, Ruosong Long, Chao Yan, Jianan Zhao, Wenwen Zhuang, Jun Yin, Peiyan Zhang, Weihao Han, Hao Sun, Weiwei Deng, Qi Zhang, Lichao Sun, Xing Xie, Senzhang Wang [PDF] [Code], 2023.11,
從大語言模型中提取事件序列知識。 preprint
Somin Wadhwa，Oktie Hassanzadeh，Debarun Bhattacharjya，Ken Barker，Jian Ni。 [PDF]，2024.1，
別忘了連接！通過基於圖的重新依據改善抹布。 preprint
Jialin Dong，Bahare Fatemi，Bryan Perozzi，Lin F. Yang，Anton Tsitsulin。 [PDF]，2024.5，
儀表：使用大語言模型KDD 2024文本歸屬圖的圖形對比度學習
Yi Fang，Dongzhe粉絲，Daochen Zha，Qiaoyu Tan。 [PDF]，2024.5，
訓練自己的GNN老師：文本圖上的圖形感知蒸餾。 PKDD 2023
C. Mavromatis，Vn Ioannidis，S。Wang，D。Zheng，S。Adeshina，J。Ma，H。Zhao，C。Faloutsos，G。Karypis。 [PDF]，2023.4，
有效的大型語言模型在圖表上進行微調。 preprint
Rui Xue，Xipeng Shen，Ruozhou Yu，Xiaorui Liu。 [PDF]，2023.12，
提煉大型語言模型，以進行文本歸類的圖形學習。 preprint
Bo Pan，Zheng Zhang，Yifei Zhang，Yuntong Hu，Liang Zhao。 [PDF]，2024.2，
參數有效調整大型語言模型，用於圖表學習。 preprint
Qi Zhu，Da Zheng，Xiang Song，Shichang Zhang，Bowen Jin，Yizhou Sun，George Karypis。 [PDF]，2024.4，
在文本屬性圖中橋接本地細節和全局上下文。 preprint
Yaoke Wang，Yun Zhu，Wenqiao Zhang，Yueting Zhuang，Yunfei Li，Siliang Tang。 [PDF]，2024.6，
圖形語言模型。 ACL 2024
莫里茨·普倫茨（Moritz Plenz），安妮特·弗蘭克（Anette Frank）。 [PDF] [代碼]，2024.1，
通過在文本豐富的網絡上學習，最小化的結構富含文本分類。 WWW 2021
Xinyang Zhang，Chenwei Zhang，Luna Xin Dong，Jingbo Shang，Jiawei Han。 [PDF] [代碼]，2021.2，
通過變異推斷學習大規模的文本屬性圖。 ICLR 2023
Jianan Zhao，Meng Qu，Chaozhuo Li，Hao Yan，Qian Liu，Rui Li，Xing Xie，Jian Tang。 [PDF] [代碼]，2023.1，
恭喜：關節圖和文本嵌入的自我監督對比預處理。 preprint
William Brannon，Suyash Fulay，Hang Jiang，Wonjune Kang，Brandon Roy，Jad Kabbara，Deb Roy。 [PDF] [代碼]，2023.5，
通過圖形的預訓練和提示來增強低資源文本分類。 SIGIR 2023
Zhihao Wen，Yuan Fang。 [PDF]，2023.5，
手榴彈：以圖形為中心的語言模型，用於在文本屬性圖上學習學習。 EMNLP 2023
Yichuan Li，Kaize Ding，Kyumin Lee。 [PDF] [代碼]，2023.10，
具有文本歸屬的異質圖的訓練語言模型。 preprint
陶祖，勒·尤，楊黃，利利·孫，鮑恩·杜。 [PDF] [代碼]，2023.10，
表8在我們的調查論文中，圖表上的大語言模型：全面的調查。
llm作為預測變量（圖）
Smiles-Bert：大規模無監督的分子特性預測預測BCB 19
Sheng Wang，Yuzhi Guo，Yuhong Wang，Hongmao Sun，Junzhou Huang [PDF] [Code]，2019.09，
Molgpt：使用變壓器描述器模型的分子生成。 Journal of Chemical Information and Modeling
Viraj Bagal，Rishal Aggarwal，PK Vinod和U. Deva Priyakumar [PDF] [Code]，2021.10 ，，，，，，，，，，，，，，，，，，，，，。
深度學習的系統橋接分子結構和生物醫學文本，具有與人類專業人士相當的理解。 Nature Communications
Zheni Zeng，Yuan Yao，Zhiyuan Liu，Maosong Sun [PDF] [Code]，2022.02，
化學形式：計算化學機器學習的預訓練的變壓器Machine Learning: Science and Technology
Ross Irwin，Spyridon Dimitriadis，Jiazhen He和Esben Jannik Bjerrum [PDF] [Code]，2022.02，
用於化學指紋識別的變壓器的大規模分佈訓練。 Journal of Chemical Information and Modeling
Hisham Abdel-Aty，Ian R. Gould [PDF] [Code]，2022.06，
Galactica：科學Preprint的大型語言模型
Ross Taylor，Marcin Kardas，Guillem Cucurull，Thomas Scialom，Anthony Hartshorn，Elvis Saravia，Andrew Poulton，Viktor Kerkez，Robert Stojnic [PDF] [Code]，2022.11，2022.11，，2022.11，，
分子與自然語言之間的翻譯。 EMNLP 2022
卡爾·愛德華茲（Carl Edwards），圖安·萊（Tuan Lai），凱文·羅斯（Kevin Ros），加勒特·霍克（Garrett Honke），kyunghyun cho，heng ji。 [PDF] [代碼]，2022.12，
通過多任務語言建模ICML 2023統一分子和文本表示
Dimitrios Christofidellis，Giorgio Giannone，Jannis Born，Ole Winther，Teodoro Laino，Matteo Manica [PDF] [Code]，2023.05，
大型語言模型可以在化學方面做什麼？八個任務的全面基準。 NeurIPS 2023
Taicheng Guo，Kehan Guo，Bozhao Nan，Zhenwen Liang，Zhichun Guo，Nitesh V. Chawla，Olaf Wiest，Xiangliang Zhang [pdf] [code]，2023.9，2023.9，，，
molxpt：用文本包裹分子進行生成預訓練。 ACL 2023
Zequn Liu，Wei Zhang，Yingce Xia，Lijun Wu，Shufang Xie，Tao Qin，Ming Zhang，Tie-Yan Liu。 [PDF]，2023.05，
與自然語言preprint互動分子發現
Zheni Zeng，Bangchen Yin，Shipeng Wang，Jiarui Liu，Cheng Yang，Haishen Yao，Xingzhi Sun，Maosong Sun，Gootong Xie，Gootong Xie，Zhiyuan Liu。 [PDF] [代碼]，2023.06，
具有大語言模型的分子捕獲翻譯的授權分子發現：chatgpt透視preprint
Jiatong Li，Yunqing Liu，Wenqi Fan，Xiao-Yong Wei，Hui Liu，Jiliang Tang，Qing Li。 [PDF]，2023.06，[代碼]，
回歸變壓器啟用並發序列回歸和分子語言建模的生成Nature Machine Intelligence
Jannis Born，Matteo Manica [PDF] [Code]，2023.6，，，，
大語言模型可以賦予分子財產預測能力嗎？ preprint
Chen Qian，Huayi Tang，Zhirui Yang，Hong Liang，Yong Liu。 [PDF] [代碼]，2023.7，
摩爾教學：大型大型分子指令數據集的大型語言模型preprint
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GPT-Molberta：GPT分子特徵分子特性預測的語言模型。 preprint
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大型語言模型對科學發現的影響：使用GPT-4的初步研究。 preprint
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邁向語言模型中的3D分子文本解釋ICLR 2024
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MOLTC：在語言模型中邁向分子關係preprint
Junfeng Fang，Shuai Zhang，Chang Wu，Zhengyi Yang，Zhiyuan Liu，Sihang Li，Kun Wang，Wenjie du，Xiang Wang。 [PDF]，2024.2，
大型語言模型是封閉式分子學習者preprint
Jiatong Li，Wei Liu，Zhihao ding，Wenqi Fan，Yuqiang Li，Qing Li。 [PDF]，2024.3，
高：用於圖形對齊預preprint層次圖像徵化
Yongqiang Chen，Quanming Yao，Juzheng Zhang，James Cheng，Yatao Bian。 [PDF]，2024.6，
分子發現：開放大型語言模型（LLM），用於幾個分子屬性預測preprint
Yuyan Liu，Sirui ding，Sheng Zhou，Wenqi Fan，Qiaoyu Tan [PDF]，2024.6，
Text2mol：帶有自然語言查詢的跨模式分子檢索。 EMNLP 2021
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Gimlet：用於基於教學的分子零射門學習的統一圖形模型。 preprint
海頓趙，劉·劉，張馬，漢南Xu，jie fu，Zhi-hong deng，lingpeng kong，Qi liu。 [PDF] [代碼]，2023.6，
PROT2TEXT：GNN和Transfers preprint的多模式蛋白的功能生成
Hadi Abdine，Michail Chatzianastasis，Costas Bouyioukos，Michalis Vazirgiannis [PDF]，2023.07，
RELM：利用語言模型來增強化學反應預測。 EMNLP 2023
Yaorui Shi，Zhang，Enzhi Zhang，Zhiyuan Liu，Xiang Wang。 [PDF] [代碼]，2023.10，
生物醫學知識圖形增強大型語言模型的迅速生成preprint
Karthik Soman，Peter W Rose，John H Morris，Rabia E Akbas，Brett Smith，Braian Peetoom，Catalina Villouta-Reyes，Gabriel Cerono，Yongmei Shi，Angela Rizk-Jackson，Sharat Israni，Sharat Israni，Charlotte A Nelson，a Nelson a nelson a nelson，Sui huang，Sergio egio egio egiio evio e huang，sergio eviio e （P.
L + M-24：構建語言 +分子的數據集 @ ACL 2024 preprint
卡爾·愛德華茲（Carl Edwards），王王（Qingyun Wang），勞倫斯·趙（Lawrence Zhao），亨吉（PDF）[代碼]，2024.2，
將分子圖與自然語言相關聯的分子多模式基礎模型。 preprint
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用於基於文本的檢索和編輯的多模式分子結構文本模型。 preprint
Shengchao Liu，Weili Nie，Chengpeng Wang，Jiarui Lu，Zhuoran Qiao，Ling Liu，Jian Tang，Chaowei Xiao，Anima Anandkumar [PDF]，2022.10，2022.10，，
從自然語言中提取分子特性，並具有多模式對比度學習ICML 2023 Workshop on Computational Biology
Romain Lacombe，Andrew Gaut，Jeff He，DavidLüdeke，Kateryna Pistunova [PDF]，2023.07，
PROTST：蛋白質序列和生物醫學文本的多模式學習。 ICML 2023
Minghao Xu，Xinyu Yuan，Santiago Miret，Jian Tang。 [PDF] [代碼]，2023.1，
在藥物發現中增強活動預測模型具有理解人類語言的能力。 ICML 2023
Philipp Seidl，Andreu Vall，Sepp Hochreiter，GünterKlambauer。 [PDF] [代碼]，2023.5，
MOLFM：多模式分子基礎模型。 Preprint
Yizhen Luo，Kai Yang，Massimo Hong，Xing Yi Liu，Zaiqing Nie。 [PDF] [代碼]，2023.7，
Git-Mol：具有圖，圖像和文本Preprint的分子科學的多模式大語言模型
Pengfei Liu，Yiming Ren，Zhixiang Ren [PDF]，2023.08，
Molca：具有跨模式投影儀和單模式適配器的分子圖模型。 EMNLP 2023
Zhiyuan Liu，Sihang Li，Yanchen Luo，Hao Fei，Yixin Cao，Kenji Kawaguchi，Xiang Wang，Tat-Seng Chua。 [PDF] [代碼]，2023.10，
Chemreasoner：使用量子化學反饋對大語言模型的知識空間進行啟發式搜索。 preprint
亨利·W·斯普魯爾（Henry W. [PDF]，2024.2，
大語模型的嘈雜註釋的實體對齊。 NeurIPS 2024
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迭代圖對齊。 preprint
Fangyuan Yu，Hardeep Singh Arora，Matt Johnson。 [PDF]，2024.8，
圖表學習可以改善基於LLM的代理商的計劃嗎？ NeurIPS 2024
Xixi Wu，Yifei Shen，Caihua Shan，Kaitao Song，Siwei Wang，Bohang Zhang，Jiarui Feng，Hong Cheng，Wei Chen，Yun Xiong，Yun Xiong，Dongsheng Li。 [PDF] [代碼]，2024.5，
GraphTeam：通過多代理協作preprint促進基於大型語言模型的大型圖形分析
Xin Li，Qizhi Chu，Yubin Chen，Yang Liu，Yaoqi Liu，Zekai Yu，Weize Chen，Chen Qian，Chuan Shi，Cheng Yang。 [PDF] [代碼]，2024.10，
GCODER：改進大型語言模型用於通用圖形問題解決preprint
Zifan Zhang，Xiaobin Hong，Jianheng Tang，Nuo Chen，Yuhan Li，Wenzhong Li，Jing Tang，Jia Li。 [PDF] [代碼]，2024.10，
基於圖的不確定性指標，用於長格式語言模型輸出NeurIPs 2024
Mingjian Jiang，Yangjun Ruan，Prasanna Sattigeri，Salim Roukos，Tatsunori Hashimoto。 [PDF]，2024.10
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@article{jin@llmgraph,
title={Large Language Models on Graphs: A Comprehensive Survey},
author={Jin, Bowen and Liu, Gang and Han, Chi and Jiang, Meng and Ji, Heng and Han, Jiawei},
journal={arXiv preprint arXiv:2312.02783},
year={2023}
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