kraken2

Kraken 2

Kraken分类序列分类系统的第二版

有关如何使用Kraken 2的详细信息，请参阅操作手册（在docs/MANUAL.html中）。

出版物

有关使用Kraken 2的其他实施详细信息和指南，您也可以参考：

• 该论文描述了Kraken的第一个版本。 请注意，Kraken 2是Kraken 1的重写，与Kraken 1不兼容。

• 描述Krakenuniq的论文。 Krakenuniq基于HLL的功能在Kraken 2中使用了操作手册中描述的--report-minimizer-data标志。

• Kraken 2纸。

• 描述使用Kraken 2的协议论文。